基于表观遗传组识别驱动细胞状态变化的核心转录因子

核心转录因子在改变细胞状态的过程中可以起到关键的驱动作用，然而对于多数细胞状态变化过程而言，究竟哪些是驱动该过程的核心转录因子尚不明确，并且缺乏有效的系统性识别方法。我们前期发表的工作表明核小体定位与转录因子结合紧密相关，且从单核小体分辨率的组蛋白修饰ChIP-seq数据可以得到功能重要区域的核小体定位图谱。在此基础上，我们提出在缺乏核心转录因子信息的情况下，通过发展生物信息学算法，分析具有核小体分辨率的组蛋白修饰的动态变化，可以有效的识别驱动细胞状态变化的核心转录因子，进而可以构建出其调控网络。本项目的研究不仅可以为深入研究细胞分化、重编程、应激反应、癌症发生等细胞状态变化过程的机制提供新的思路，而且也可以深化我们对于转录因子结合、核小体定位及修饰的动态变化、基因转录调控三者之间关系的理解。

转录因子在细胞状态改变的过程中可以起到关键的驱动作用，然而对于多数细胞状态变化过程而言，究竟哪些是关键的转录因子尚不明确，并且缺乏有效的系统性识别方法；近年来表观遗传组学的发展为建立一套系统方法提供了新的思路。本项目特别关注表观遗传组动态变化，通过发展生物信息学方法取得了一系列研究成果，主要体现在三个方面：1）发展了生物信息学方法，基于组蛋白修饰识别细胞状态变化过程中的特异性转录因子；2）发展了生物信息学方法，研究以核小体定位为代表的染色质结构的动态变化；3）发展及更新了相关的生物信息学方法和数据库。共在Genome Research, Nucleic Acids Research, Bioinformatics, Epigenetics等重要学术期刊发表论文8篇。本研究成果不仅可以为系统研究细胞分化、重编程、应激反应、癌症发生等细胞状态变化过程的机制提供新的思路，而且也可以深化对于转录因子、表观遗传组动态变化、基因转录调控三者之间关系的理解。