细胞DNA损伤应激反应是一个很复杂的过程,最终可导致细胞周期停滞、DNA修复或凋亡,但其中的机制还未完全明确。我们在前期研究中发现在DNA损伤的细胞中有剪接因子SR家族基因的高表达,并伴随变异剪接活性的增高,还证明CD44和Fas分子发生了变异剪接。但是对于在此过程中是否有其他基因发生变异剪接,以及发生变异剪接的基因在DNA损伤应激反应中的作用还不清楚。因此我们拟利用全基因组变异剪接分析技术,系统地鉴定在DNA损伤中发生变异剪接的基因,并对鉴定的部分基因在DNA损伤后对细胞周期、DNA修复以及凋亡的影响进行分析,从而阐明变异剪接在DNA损伤应激中的作用。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
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