应用单链构象多态性技术对球形马拉色菌亲缘地理学的研究

马拉色菌属是一种全球分布、致病或与多种皮肤疾病有关的酵母样菌。既往的流行病学抽样调查显示其具有明显的生物多样性。但少有马拉色菌在不同种族人群和地理之间的亲缘地理学及与人类迁徙、遗传等关系的研究。我们的前期研究已首次证实糠秕马拉色菌的亲缘地理发育可能与疾病、种族及地域有关，但关于人携带马拉色菌的主要菌种-球形马拉色菌的亲缘地理学研究，迄今国内外尚无报道。我们拟选取中国和南亚（印度、尼泊尔、巴基斯坦）部分人群，对同一个体在不同时间点上分离并经形态和生化鉴定为球形马拉色菌后，采用成对PCR单链构象多态性对其ITS1区及chs-2基因进行分析，多位点突变筛查分析基因序列，判断其亲缘地理发育差异，以及与人群迁徙、地理、疾病的关系。本课题预期将揭示球形马拉色菌的遗传变异相关因素，研究成果将有助于丰富菌种生态学及生物多样性和流行病学资料，并为人类学及法医物证等提供借鉴和帮助。

马拉色菌属是一种全球分布、致病或与多种皮肤疾病有关的酵母样菌。既往的流行病学抽样调查显示其具有明显的生物多样性。但少有马拉色菌在不同种族人群和地理之间的亲缘地理学及与人类迁徙、遗传等关系的研究。我们的前期研究已首次证实糠秕马拉色菌的亲缘地理发育可能与疾病、种族及地域有关，但关于人携带马拉色菌的主要菌种-球形马拉色菌的亲缘地理学研究，迄今国内外尚无报道。本项目从2011年实施，历时三年。目前已经完成临床样本量的采集，对采集的样本进行了整理、信息归类。在此期间进行了项目方法的摸索，主要是菌种的鉴定分型，并发表了相关文章。对鉴定出的球形马拉色菌进行DNA的提取和测序鉴定。目前所需的球形马拉色菌DNA已经收集完成，并用单链构象多态性技术对早期的部分样本进行了检测，采用Bionumerics软件进行了分析。前期部分结果显示不同地域来源和种族来源的球形马拉色菌其基因型存在差异，在种族发育上表现为亲缘关系远近的不同。但因为需要采集同一个体不同时段（2年）的皮肤标本，耗时较长，故整体样本的亲缘关系差异分析仍未完成。这期间，发表了相关技术操作、菌种鉴定分型技术的SCI文章2篇，中文核心期刊三篇。后续研究仍按计划进行。