多通路候选基因单体型与唇腭裂风险的相关性研究

非综合征性唇裂伴或不伴腭裂( nonsyndromic cleftwith or without cleft palate，NSCL /P)是一种常见的先天颜面部缺陷，其发病与多基因遗传有关，但目前仍处于探索中。候选基因/区域单体型的相关研究可以更全面深刻地解释NSCL /P的发病机制。牙齿形成相关基因、FGF信号传导通路、叶酸代谢通路和解毒通路与NSCL /P的发生相关。现已发现基于HapMap数据库的基因单体型比传统候选SNPs更能反映该基因与NSCL /P病因的相关性。但对于中国汉族人种尚无相关报道。因此我们拟通过对多条通路上的多个候选基因进行全基因/区域的单体型研究，系统地探寻基因型与NSCL /P病因的综合作用，建立基因－临床风险预测模型，以期在基因水平上预测发生NSCL /P病因的风险。

收集204 例非综合征性唇腭裂病人和226例正常人外周血。采用Sequenom MassArray飞行时间质谱生物芯片系对11个基因86个SNP位点进行检测。获得如下结果：（1）IRF6的rs2073485，rs2235371，rs2236909和rs861020位点与非综合征性唇腭裂明显相关，PAX9的rs17176643位点与非综合征性唇腭裂边缘性相关，IRF6的rs2073485，rs2235371和rs2236909位点与PAX9的rs17176643位点存在交互作用，其危险因素使非综合征性唇腭裂发生的危险明显增高。（2）MTR中的rs4077829 和rs10802565位点与非综合征性唇腭裂边缘性相关。（3）NAT1中的rs4921580 位点和NAT2中的rs1041983位点与非综合征性唇腭裂相关，NAT1中的rs4921580 位点和NAT2中的rs1041983位点存在交互作用，其危险因素使非综合征性唇腭裂发生的危险明显增高。