动物数量性状候选基因单倍体型分析方法及其应用研究

动物数量性状候选基因分析存在很多问题：一是一个候选基因中可能有多个多态位点；二是多个候选基因可能同时影响一个性状；三是因为一个性状可能涉及众多基因且易受环境影响而使一个基因效应较小、难以检测；四是候选基因在被用于辅助选择或保种时缺乏可操作性，尤其是在存在多个基因、每个基因又有多个多态位点时。目前，在人类基因组研究中，单倍体型分析已被运用到SNP位点与复杂疾病间的关联分析中。然而，这种方法只能分析单个基因中或单条染色体区域内的SNPs，故不适于分散到多个基因和染色体上的动物数量性状候选基因多态位点分析。据此，我们拟创造性地提出数量性状单倍体型的分析方法，包括单倍体型检测、单倍体域确定、单倍体型标签SNP筛选、关联分析、遗传参数估计以及辅助保种与选择等诸方面，通过模拟研究检验其有效性，并进而将其用到梅山猪繁殖性状候选基因研究中去，既解决实际问题又验证有关方法。