利用关联分析和连锁分析发掘甘蓝型油菜分枝优异等位变异

The number of primary branches (FB) is an important agronomic trait of rapeseed. In this research, yield and quality related traits were investigated and analyzed for 250 Brassica napus inbred lines, and the 96 B. napus inbred lines will be genotyped using SSR, SRAP or SNP molecular markers. The extent of linkage disequilibrium (LD) between markers is examined, and its features are revealed. Meanwhile, the association mapping between markers and FB data are performed, and some markers or chromosomal regions involved in FB will be characterized. The major QTLs for tillering-like trait will be identified through composite interval mapping analyses in the F2 segregating population. Combining the fine association mapping and linkage analysis, the accuracy of QTL mapping will be further improved, and some elite alleles for FB will be screened out. These results give an insight into the characteristics of LD in Brassica napus, and obtaining target gene,allelic variants for high yield breeding, and provide the solid foundation for functional analysis of candidate genes.

一次有效分枝数是甘蓝型油菜的一个重要农艺性状。本项目在鉴定250份甘蓝型油菜种质材料的产量和品质相关性状的基础上，利用SSR、SRAP、SNPs等标记检测96份代表性材料的基因型；通过标记连锁不平衡的分析揭示甘蓝型油菜的连锁不平衡特征；通过基因型与一次有效分枝数表型关联分析，鉴定出与一次有效分枝数显著关联的基因／染色体区段；利用F2分离群体对类分蘖一次有效分枝数进行区间作图，鉴定类分蘖一次有效分枝数主效QTLs；在此基础上，通过关联分析与连锁分析相结合的方法，进一步提高定位的准确性，并筛选出一次有效分枝数的优异等位变异。研究结果对了解甘蓝型油菜连锁不平衡特征、发掘育种目标基因及其等位变异油菜高产育种有重要意义，也是下一步开展候选基因功能分析的基础。

（1）一次有效分枝数是甘蓝型油菜品种选育中关注的重要农艺性状，优异的种质材料缺乏，是限制密植高产油菜新品种选育的关键。本项目利用分子标记与表型鉴定，从627份核心种质遴选遗传多样性高的300份种质构成自然群体，并获得10份一次分枝优异种质，为品种选育奠定基础。.（2）甘蓝型油菜遗传多样性低是限制高产品种改良的重要因素。利用重测序和224个SSR 标记，揭示甘蓝型油菜的连锁不平衡特征，整个基因组的衰减距离为18.8 kb(R2=0.28)。该特征为油菜加强C基因组改良的策略提供理论支撑。.（3）针对油菜一次分枝数及分枝角度的标记开发少有报道，本项目对自然群体一次有效分枝数进行4年2点表型鉴定，全基因组关联分析获得12个位点，同时在chrC04 号染色体上定位得到类分蘖基因位点；构建了包含208个株系的DH群体，利用基因芯片获得高密度遗传连锁图谱1张, 并分别定位一次有效分枝角度和一次分枝部位QTLs/染色体区段4个和5个；在自然群体中共获得一次分枝优异等位变异7个。为分子标记辅助育种提供支撑。.（4）申请专利3项，发表SCI论文4篇。