单分子运动学的分子动力学计算与系统生物学方法

近年来，单分子实验技术的快速发展为分析生物分子在细胞中的活动机理提供新的课题。尤其是在理论和计算的研究上急待推进新的方法。本项目提出基于单分子运动学模型（AGGREGATED MARKOV MODEL），利用计算结构生物学中的COARSE-GRAINED模型（ENM）和大时间尺度的分子动力学模拟（TMD），同时结合建立系统生物学中的生化反应模型，试图创建一个新的计算理论框架，用于揭示详细的生物分子运动机理和其在生化系统中所起的做用。该项目旨在利用传统上分离的理论和计算方法，结合相应的实验数据源，已准确进行单分子动力学建模和对其功能提出综合性预测。