In our previous circRNA chip experiment on screening circular RNAs, we found circ0008157 was reduced expression in melanoma cells. Preliminary study showed circ0008157 inhibited progress of melanoma cells via silencing VEGF-A,the most important factor in angiogenesis. According to bioinformatics software, circ0008157 is predicted to be a target of miR-197-5p and miR-335-3p. And CYP4Z1 is the target gene of these two microRNAs. In this study, we aim at proving the angiogenesis phenotype suppressed by circ0008157 through sponging miR-197-5p and miR-335-3p in melanoma. We will explore the relationgship among circ0008157, miR-197-5p, miR-335-3p, CYP4Z1 and angiogenesis level of melanoma cells in vitro. Finally, we will discuss the value of circ0008157、miR-197-5p and miR-335-3p and angiogenesis related factors in melanoma patients by analyzing the collected clinical samples.
前期circRNA芯片发现circ0008157在黑色素瘤细胞中低表达,预实验发现circ0008157通过负向调控VEGF-A抑制黑色素瘤发生发展,而VEGF-A是促血管生成的关键因子。生物信息学分析及预实验microRNA芯片结果提示miR-197-5p及miR-335-3p与circ0008157均存在结合位点,且共同靶向CYP4Z1。本课题将以circ0008157调控miR-197-5p、miR-335-3p抑制黑色素瘤血管生成为主轴,从分子、细胞和动物实验三个层次探讨circ0008157海绵吸附miR-197-5p、miR-335-3p导致CYP4Z1蓄积抑制血管生成的机制;最后回归临床,探讨黑色素瘤中circ0008157、miR-197-5p、miR-335-3p及血管生成相关分子的表达量的临床意义。
前期circRNA microarray分析筛出circ0008157 与皮肤黑素瘤进展有关,并在黑素瘤组织及高侵袭力黑色素瘤细胞中低表达。预实验发现circ0008157 可抑制WM35及WM451细胞系的迁移侵袭。本课题首先通过FISH技术及核质分离实验,验证此circ0008157 在皮肤黑素瘤细胞系中的定位,预测可能调控机制;在此基础上,一方面通过生物信息学筛查并验证circ0008157 可能靶向结合的蛋白,另一方面利用RIP、RNA-pull down、FISH等方法,探索circ0008157与SENP3的互作关系,circ0008157对SENP3/HIF-1α 复合物稳定性的影响,以及circ0008157通过与SENP3相互作用,调节HIF-1α 的SUMO化影响其稳定性;再通过基因功能恢复实验,确定circ0008157通过调控核内蛋白功能参与黑素瘤进展的具体机制;利用circ0008157 上调及circ0008157及HIF-1α 均上调的WM35细胞系,分别构建异种移植瘤模型,从动物水平验证此circ0008157参与皮肤黑素瘤进展,以及上调HIF-1α 对逆转circ0008157对肿瘤增长的抑制作用;最后回到临床,探索circ0008157、靶基因、信号通路关键靶分子在组织及血液标本中的表达情况,筛选出黑素瘤可能的治疗靶点及早期诊断和预后监测的指标。
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数据更新时间:2023-05-31
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