可变剪接基因的模式识别与克隆验证

可变剪接是产生蛋白功能多样性和控制基因表达的重要机制，是功能基因组时代研究重点。生物信息学在分析可变剪接基因结构、功能和调控方式方面具有独特作用。然而，目前的研究都是基于全基因组或cDNA序列与EST比对来分析基因可变剪接和开发识别程序，具有局限性。由于目前还没能力对所有物种都进行全基因组测序，因此限制了它的实用性。为此，本课题开展基于EST序列而不依赖于Genome或cDNA序列的基因可变剪接预测程序的研究，具有重要意义。本项目利用生物信息学以及机器学习理论开发基于EST的可变剪接基因识别程序，对日本七鳃鳗唾液腺转录组可变剪接基因进行计算机识别，并对预测的基因进行分子克隆，研究基因可变剪接模式，探索基因可变剪接的起源和进化机制；利用实验获得的数据对上述计算机预测结果进行验证，开发七鳃鳗可变剪接基因预测算法，建立我国特色的七鳃鳗功能基因组学研究平台，为深入了解基因组的表达调控机制奠定基础。