转录因子USF1在小鼠肝再生早期转录调控中的作用机制研究

肝再生是肝脏组织受到损伤或切除后自身修复的重要途径，涉及细胞增殖、分化和凋亡等多个生物学过程。肝再生早期的启动阶段对再生是否成功起到了至关重要的作用，该过程错综复杂，分子机制远未完全阐明。本课题组前期工作通过国际先进的转录因子活性筛选技术发现，在小鼠肝再生早期，包括USF1在内的一批少见报道的转录因子发生了活性改变。本项目拟在此基础上，以USF1为研究重点，通过免疫共沉淀结合质谱的方法研究与USF1协同作用的蛋白复合物；通过染色质免疫共沉淀结合深度测序的方法研究USF1的靶基因；结合肝再生早期全转录组基因表达变化和生物信息学研究手段，构建小鼠肝再生早期以USF1为核心的转录调控网络。同时通过慢病毒载体系统，基因过表达/剃降等技术手段，在体内和体外水平进行USF1及重要靶基因的生物学功能研究，为全面了解小鼠肝再生早期的基因表达调控机制奠定坚实的分子基础。

肝再生是肝脏组织受到损伤或切除后自身修复的重要途径，涉及细胞增殖、分化和凋亡等多个生物学过程。肝再生早期的启动阶段对再生是否成功起到了至关重要的作用，该过程错综复杂，分子机制远未完全阐明。本课题以转录因子活性谱芯片技术筛选的转录因子USF1为研究重点，通过染色质免疫共沉淀结合芯片（ChIP-on-chip），肝再生早期全基因组表达谱芯片以及生物信息学等研究手段，构建了小鼠肝再生早期以USF1为核心的转录调控网络；并通过ChIP实验验证了早期肝再生组织中USF-1及其它转录因子对多个下游重要功能基因的协同调控作用；此外，我们还通过慢病毒载体系统进一步在体外水平验证了USF1对下游靶基因表达水平的调控。本课题为全面了解小鼠肝再生早期的基因表达调控机制奠定坚实的分子基础。