先天性白内障新致病基因的定位克隆及功能研究

基本信息
批准号:30901652
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:夏欣一
学科分类:
依托单位:南京大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:崔英霞,薛春燕,杨滨,周鑫,高建,王浩洋,胡毓安
关键词:
定位克隆先天性白内障基因功能分析发病机制致病基因
结项摘要

先天性白内障是常见的致盲性眼病,约1/3与遗传缺陷有关,推测致病基因有30余个,已确定17个。我们收集了6个先天性白内障家系和302例散发病例DNA样本,其中1个涉及5代85人有17例患者的大家系,前期研究已排除17个已知基因和12个染色体区域,提示存在新的致病基因。本研究采用定位候选克隆策略,用Affymetrix SNP基因芯片进行全基因组扫描和连锁分析,确定候选区域后精细定位,对定位区域内候选基因进行突变检测,确定新的白内障致病基因,并在已收集的家系及病例中证实。在分离鉴定新基因的基础上进行功能分析,通过RT-PCR、免疫组化、Western blot、生物信息学等方法分析基因编码蛋白的定位和表达谱,初步探讨该基因突变导致白内障的分子机理。本研究有可能发现先天性白内障新基因,有助于阐明先天性白内障新的发病机制,并为基因诊断、遗传咨询、产前诊断和基因治疗奠定实验基础。

项目摘要

先天性白内障是常见的儿童致盲性眼病,约1/3与遗传缺陷有关,推测致病基因有30余个,已确定17个。我们在国家自然科学基金青年基金项目“先天性白内障新致病基因的定位克隆及功能研究”(30901652)的资助下,收集了多个先天性白内障家系,其中1个涉及5代85人有17例患者的大家系,前期研究已排除17个已知基因和12个染色体区域,提示存在新的致病基因。本研究采用定位候选克隆策略,用Affymetrix Human Mapping 500K Array芯片实验平台进行全基因组扫描和连锁分析,主要包括基因组DNA的酶切、连接、PCR扩增、扩增产物的片段化、生物素标记、芯片杂交反应、清洗染色扫描、数据处理和分析。对chr13q33-34(105,852,930-109,154,152)上分析显示,共有6个候选基因LIG4 ,MYR8,IRS2,COL4A1 ,COL4A2。DNA测序结果表明,所有病人的COL4A1基因的外显子31首个碱基上发生g. 133114 G>C(c.2345G>C)杂合突变,推测蛋白质氨基酸序列发生Gly782Ala突变,而有血缘正常人和家系中配偶均未见这一突变。Pvu II双酶切证实了DNA测序结果,同源性分析显示Gly782为一保守位点。COL4A1基因突变c.2345G>C尚未见文献报道。结果表明,本课题首次发现IV型胶原α1亚基COL4A1基因c.2345G>C(p.G782A)杂合突变是先天性白内障大家系的分子基础。首次发现COL4A1基因作为单纯性(非综合征)先天性白内障的致病基因,在此结果的基础上,我们提出晶状体基底膜缺陷和内质网应激信号通路变化两种假说,今后进一步研究COL4A1基因突变致先天性白内障的分子机制。本研究有助于阐明先天性白内障新的发病机制,并为基因诊断、遗传咨询、产前诊断和基因治疗奠定实验基础。本课题共发表SCI论文2篇,中文核心期刊论文16篇,培养硕士研究生5人,获科技奖励3项。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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