急性脑梗死血瘀证与其基因共表达网络动态关联模型研究

Zhenghou has temporal-spatial dynamic property，which macroscopic dynamic change should be associated with the corresponding microscopic transcriptomic network system. However, recent studies on this relationship mostly were the static cross-section analysis, rather than the quantitative analysis of dynamic association. Previously, We had established a T-pharmacodynamics model of Xueyu Zheng. This study continue to construct a quantitative dynamic model on the relationship between the acute cerebral infarction (Xueyu Zheng) and the dynamic differential gene co-expression network based on the data from an ongoing trial on Danhong injection for the treatment of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng). Firstly, using the temporal data of mRNA omics data on Day 0,Day 14 and Day 90, we will build a dynamic gene co-expression network of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng), and obtain the core dynamic module using the analysis of dynamic frequent subgraph. Secondly, we will establish the quantitative correlation model between the symptoms Score of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng) and the gene expression of the core dynamic module based on the previous T-pharmacodynamics model of Xueyu Zheng using the differential network analysis of the partial least squares (PLS)regression. Finally, we will analysis the molecular function of the core dynamic module through GO and KEGG enrichment anlysis to reveal the molecular mechanism of transcription regulation for the dynamic property of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng). Our study will provide a method on the annotation for the dynamic property of Zhenghou.

证候具有“动态时空”属性，其宏观的动态改变必然有微观组学网络系统与之相对应。然而目前这种对应关系的研究多为对横断面的静态定性分析，尚未开展证候与其对应基因网络的动态关联定量分析。本研究在前期建立的血瘀证证候动态变化的时效定量模型基础上，依托丹红注射液治疗急性脑梗死血瘀证3个时间点的mRNA组学数据（0天，第14天，第90天），构建急性脑梗死血瘀证差异基因共表达动态网络，采用动态频繁子图法挖掘基因共表达动态网络的核心动态模块，然后采用偏最小二乘差异网络分析法结合前期血瘀证证候时效动力学模型，建立急性脑梗死血瘀证与基因共表达网络核心动态模块的定量关联，通过GO功能富集和KEGG通路富集分析核心动态模块，揭示证候动态变化的转录调控机制，从而从微观层面诠释证候随时间改变的动态属性特征。

证候具有“动态时空”属性，其宏观的动态改变必然有微观组学网络系统与之相对应。然而目前这种对应关系的研究多为对横断面的静态定性分析，尚未开展证候与其对应基因网络的动态关联定量分析。本研究依托28例丹红注射液治疗急性脑梗死血瘀证的动态蛋白质组学数据（0天，第14天，第90天），通过与正常人比较，获得丹红注射液治疗急性脑梗死血瘀证差异蛋白66个，采用加权差异基因共表达分析法和动态网络构建方法构建丹红注射液治疗第90天血瘀证痊愈人群及对照组人群的66个差异蛋白共表达网络在90天内的急性脑梗死血瘀证差异蛋白共表达动态网络，通过组间比较和动态频繁子图法挖掘基因共表达动态网络的核心动态模块，然后采用典型相关分析等相关性分析法，建立急性脑梗死血瘀证动态变化与基因共表达网络核心动态模块的定量关联，获得随证候动态变化显著相关（p＜0.05）的核心动态差异蛋白子网，通过Metascape富集该子网的生物学功能，我们发现丹红注射液治疗血瘀证与钙离子通道，cAMP能量代谢以及肾素-血管紧张素-醛固酮系统密切相关，我们的研究提供一种揭示证候动态变化的蛋白水平机制的方法，从而从微观层面诠释证候随时间改变的动态属性特征。