应用量子化学从头算(φψχ1)三维势能面提高蛋白质经验分子力场的精度

基本信息
批准号:20773160
项目类别:面上项目
资助金额:26.00
负责人:汪志祥
学科分类:
依托单位:中国科学院大学
批准年份:2007
结题年份:2010
起止时间:2008-01-01 - 2010-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:于淑媛,刘涛,张成根
关键词:
量子化学从头算经验力场分子动力学生物大分子
结项摘要

经验分子力场是计算机模拟生物大分子的基础和核心。根据近年来发展起来的快速GB溶剂模型和本人近年来在这方面的探索,我们建议使用更精确的考虑了溶剂效应的量子化学从头算结果来进行与GB溶剂模型匹配的经验力场参数化。该方法包括:(1)利用数值插值的方法,使用量子化学从头算的(φ ψ χ1)三维势能面表示力场中所对应的φ ψ χ1二面角扭转能。(2)根据氨基酸的个性和特性,分组使用不同的势能面。(3)根据量子化学计算的溶剂化能,优化GB半径。该方法可以克服现有力场参数化中出现的一些缺点,提高力场的精度,为今后更准确的模拟生物大分子打下基础。

项目摘要

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

EBPR工艺运行效果的主要影响因素及研究现状

EBPR工艺运行效果的主要影响因素及研究现状

DOI:10.16796/j.cnki.1000-3770.2022.03.003
发表时间:2022
2

外泌体在胃癌转移中作用机制的研究进展

外泌体在胃癌转移中作用机制的研究进展

DOI:10.12354/j.issn.1000-8179.2021.20201763
发表时间:2021
3

珠江口生物中多氯萘、六氯丁二烯和五氯苯酚的含量水平和分布特征

珠江口生物中多氯萘、六氯丁二烯和五氯苯酚的含量水平和分布特征

DOI:10.7524 /j.issn.0254-6108.2017122903
发表时间:2018
4

猪链球菌生物被膜形成的耐药机制

猪链球菌生物被膜形成的耐药机制

DOI:10.13343/j.cnki.wsxb.20200479
发表时间:2021
5

施用生物刺激剂对空心菜种植增效减排效应研究

施用生物刺激剂对空心菜种植增效减排效应研究

DOI:10.11654/jaes.2022-0087
发表时间:2022

相似国自然基金

1

处理大活性空间的从头算量子化学新方法

批准号:21373109
批准年份:2013
负责人:马海波
学科分类:B0301
资助金额:80.00
项目类别:面上项目
2

稀土掺杂材料光谱性质从头算和半经验理论研究

批准号:11347172
批准年份:2013
负责人:苏萍
学科分类:A25
资助金额:5.00
项目类别:专项基金项目
3

基于从头算能量点和实验光谱数据发展新的势能面构造方法

批准号:11474141
批准年份:2014
负责人:李永庆
学科分类:A2101
资助金额:72.00
项目类别:面上项目
4

大分子直链烷烃高精度从头算燃烧反应动力学的研究

批准号:91641105
批准年份:2016
负责人:张鹏
学科分类:E0604
资助金额:60.00
项目类别:重大研究计划