蛋白质结构快速比较算法及其应用

基本信息
批准号:90608005
项目类别:重大研究计划
资助金额:30.00
负责人:郑伟谋
学科分类:
依托单位:中国科学院理论物理研究所
批准年份:2006
结题年份:2009
起止时间:2007-01-01 - 2009-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李恒,王晟,史华林
关键词:
蛋白结构比较构象态码替代矩阵蛋白结构和功能预测
结项摘要

蛋白质结构比较算法对于结构分类、结构模体识别、追踪分子演化及蛋白结构和功能预测至关重要,现有算法未能充分兼顾速度和可靠性。以C-alpha原子伪键表示蛋白质三维骨架,结构可由折角、扭角方便地描述。四肽段是坐标和角度彼此一一对应的最小基本单元。基于四肽段的三角度代表点在相空间的密度分布对构象态作聚类,可获得离散构象态码。构象态码将三维结构转化为一维字母序列。借助结构相似蛋白家族库FSSP,可收集构象

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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