Familial hypercholesterlolemia (FH) is a autosomal dominant disorder, the higher rate of premature coronary heart disease has been concerned by the world. But our country still have not enough attention. With standard molecular diagnostic techniques, a familial hypercholesterolaemia-causing mutation can be detected only in 30% of patients with FH. Recent researches have showed a substantial polygenic contribution might add to the variable penetrance of FH. We performed target exome sequencing of 95 genes by previous National Natural Science Foundation and detected a great number of single nucleotide polymorphism (SNP).We found 12 high frequency of SNP, but it is not clear that how to dig out the key locations from a FH and whether these SNPs affect cholesterol metabolism andinteraction? We hypothesized that "In addition to the monogenic mechanisms in FH subjects, there may also exist polygenic co-effect". This project will first study the Northern Han FH nuclear family by a larger sample, use the target exome sequencing chip to array genotype; use bioinformatics method to predict the 12 SNPs influence on cholesterol metabolism; use the single-point mutation and two-point mutation, single transfection and co-transfection and siRNA to specify the SNPs; observe the effect of variation of protein on LDL receptor function and cholesterol metabolism; enlarge the sample detection of 12 SNP in undetected mutations in patients with FH to verify our hypothesis. This is important for the early diagnosis of FH.
家族性高胆固醇血症(FH)是常见单基因遗传病,因高冠心病风险受国际高度关注。研究发现LDL受体等3种FH致病基因突变仅能解释30%患者,其余患者病因不明。新近报道,脂代谢相关多个微效基因协同作用也参与FH发病;我们前期在国家自然基金资助下构建了脂代谢相关95个基因外显子捕获芯片,在未检测到致病突变的FH患者中检测到大量SNP,其中12个频率较高,但它们是否是FH关键基因位点、并通过协同作用影响胆固醇代谢有待研究。我们提出"FH发病除单基因致病机制外,可能还存在多基因协同作用机制"的假说。拟收集北方汉族FH核心家系,利用外显子芯片进行基因分型;生物信息学预测12个SNP功能;以肝细胞为模型,采用单点和双点诱变、单转染和共转染及基因沉默技术,分别观察12个SNP及组合所编码变异蛋白对LDL受体功能和胆固醇代谢的影响;在未发现突变的患者中检测12个SNP;验证假说。本项目对FH早期诊断意义重大。
FH纯合型是罕见病,是胆固醇增高导致冠心病的典型范例,患者青少年期即可发生冠心病心梗,是冠心病最高危的人群。本项目在完成收集101例临床确诊为FH纯合型患者的基础上,自行设计构建升级版的脂代谢相关基因SNP及其外显子捕获芯片,结合二代测序分析患者高发SNPs及基因热点突变,获得成果如下:(1)发现大量SNPs和新位点,但排名前50位SNPs中仅5个与英国评分模型中的SNP重合,(2)FH患者发现主要致病基因突变的同时还检测到一些SNPs,证实了FH除主效基因还存在辅效基因共同促进FH发病的假设,更新了人们认为FH仅为单基因疾病的认识。(3)生物信息分析发现60个可能的致病性变异(SNVs),分别位于LDLR、APOB、PCSK9与LDLRAP1基因上,其中11个新位点;还发现8个可能致病的插入或缺失变异(indels),位于LDLR基因,其中5个新位点。(4)患者致病基因以LDLR基因突变为主,以复合杂合居多,发现其中3个高频突变位点是W483X,H583Y与A627T,占42.% 主要分布在安徽、河南与湖北省,这些发现有利于缩小测序池,为FH的快速筛查早期诊断奠定了实验基础。(5)鉴别诊断出15例植物固醇血症(STSL)患者,STSL为罕见的隐性遗传性疾病,但是依折麦布联合他汀可预防心血管发生,因此本项目不仅对该病患者早期诊断意义重大,而且为我国罕见病增加了新的数据库。(6)创新型建立了LDLR双突变的荧光表达载体,未见相关报道,有助于发现突变或SNP对LDL代谢的叠加作用,与WT组相比,W483X等突变体对细胞LDL的内吞能力显著降低。虽然目前未找到合适的SNP组合,望扩大样本进一步分析SNP组合特点,作出我国的评分模型。本项目发表了论文16篇,其中SCI论文11篇,课题组成员获得国家自然科学基金3项,其他行业课题5项;培养研究生7名;参加国际会议发言多次并举办了中国-荷兰血脂论坛。此外,协助罕见病纯合FH的孤儿药--降脂新药瑞百安在我国上市并参与中华慈善总赠药项目。总之,本项目对于我国FH研究起到积极的推动作用,带来良好的社会效益,对于FH高危人群的早期诊断早期治疗意义重大。
{{i.achievement_title}}
数据更新时间:2023-05-31
玉米叶向值的全基因组关联分析
监管的非对称性、盈余管理模式选择与证监会执法效率?
基于 Kronecker 压缩感知的宽带 MIMO 雷达高分辨三维成像
宁南山区植被恢复模式对土壤主要酶活性、微生物多样性及土壤养分的影响
针灸治疗胃食管反流病的研究进展
JAK-STAT信号通路介导DEHP致脂代谢紊乱的作用机制
乳香中调节脂质代谢西松烷二萜类成分的发现、作用机制与构效关系研究
大豆异黄酮及代谢产物S(-)雌马酚对不同雌马酚代谢表型高胆固醇血症绝经期后妇女脂代谢影响机制研究
Tip60在脂代谢调控中的作用机制研究