脂代谢中微效多基因协同作用致遗传性高胆固醇血症的机制研究

基本信息
批准号:81471098
项目类别:面上项目
资助金额:75.00
负责人:王绿娅
学科分类:
依托单位:首都医科大学
批准年份:2014
结题年份:2018
起止时间:2015-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王旭,曾哲纯,徐盛媛,陈永福,隋硕,武文峰,江龙,李宜嘉,王海红
关键词:
脂代谢微效多基因家族性高胆固醇血症早期诊断单核苷酸多态性
结项摘要

Familial hypercholesterlolemia (FH) is a autosomal dominant disorder, the higher rate of premature coronary heart disease has been concerned by the world. But our country still have not enough attention. With standard molecular diagnostic techniques, a familial hypercholesterolaemia-causing mutation can be detected only in 30% of patients with FH. Recent researches have showed a substantial polygenic contribution might add to the variable penetrance of FH. We performed target exome sequencing of 95 genes by previous National Natural Science Foundation and detected a great number of single nucleotide polymorphism (SNP).We found 12 high frequency of SNP, but it is not clear that how to dig out the key locations from a FH and whether these SNPs affect cholesterol metabolism andinteraction? We hypothesized that "In addition to the monogenic mechanisms in FH subjects, there may also exist polygenic co-effect". This project will first study the Northern Han FH nuclear family by a larger sample, use the target exome sequencing chip to array genotype; use bioinformatics method to predict the 12 SNPs influence on cholesterol metabolism; use the single-point mutation and two-point mutation, single transfection and co-transfection and siRNA to specify the SNPs; observe the effect of variation of protein on LDL receptor function and cholesterol metabolism; enlarge the sample detection of 12 SNP in undetected mutations in patients with FH to verify our hypothesis. This is important for the early diagnosis of FH.

家族性高胆固醇血症(FH)是常见单基因遗传病,因高冠心病风险受国际高度关注。研究发现LDL受体等3种FH致病基因突变仅能解释30%患者,其余患者病因不明。新近报道,脂代谢相关多个微效基因协同作用也参与FH发病;我们前期在国家自然基金资助下构建了脂代谢相关95个基因外显子捕获芯片,在未检测到致病突变的FH患者中检测到大量SNP,其中12个频率较高,但它们是否是FH关键基因位点、并通过协同作用影响胆固醇代谢有待研究。我们提出"FH发病除单基因致病机制外,可能还存在多基因协同作用机制"的假说。拟收集北方汉族FH核心家系,利用外显子芯片进行基因分型;生物信息学预测12个SNP功能;以肝细胞为模型,采用单点和双点诱变、单转染和共转染及基因沉默技术,分别观察12个SNP及组合所编码变异蛋白对LDL受体功能和胆固醇代谢的影响;在未发现突变的患者中检测12个SNP;验证假说。本项目对FH早期诊断意义重大。

项目摘要

FH纯合型是罕见病,是胆固醇增高导致冠心病的典型范例,患者青少年期即可发生冠心病心梗,是冠心病最高危的人群。本项目在完成收集101例临床确诊为FH纯合型患者的基础上,自行设计构建升级版的脂代谢相关基因SNP及其外显子捕获芯片,结合二代测序分析患者高发SNPs及基因热点突变,获得成果如下:(1)发现大量SNPs和新位点,但排名前50位SNPs中仅5个与英国评分模型中的SNP重合,(2)FH患者发现主要致病基因突变的同时还检测到一些SNPs,证实了FH除主效基因还存在辅效基因共同促进FH发病的假设,更新了人们认为FH仅为单基因疾病的认识。(3)生物信息分析发现60个可能的致病性变异(SNVs),分别位于LDLR、APOB、PCSK9与LDLRAP1基因上,其中11个新位点;还发现8个可能致病的插入或缺失变异(indels),位于LDLR基因,其中5个新位点。(4)患者致病基因以LDLR基因突变为主,以复合杂合居多,发现其中3个高频突变位点是W483X,H583Y与A627T,占42.% 主要分布在安徽、河南与湖北省,这些发现有利于缩小测序池,为FH的快速筛查早期诊断奠定了实验基础。(5)鉴别诊断出15例植物固醇血症(STSL)患者,STSL为罕见的隐性遗传性疾病,但是依折麦布联合他汀可预防心血管发生,因此本项目不仅对该病患者早期诊断意义重大,而且为我国罕见病增加了新的数据库。(6)创新型建立了LDLR双突变的荧光表达载体,未见相关报道,有助于发现突变或SNP对LDL代谢的叠加作用,与WT组相比,W483X等突变体对细胞LDL的内吞能力显著降低。虽然目前未找到合适的SNP组合,望扩大样本进一步分析SNP组合特点,作出我国的评分模型。本项目发表了论文16篇,其中SCI论文11篇,课题组成员获得国家自然科学基金3项,其他行业课题5项;培养研究生7名;参加国际会议发言多次并举办了中国-荷兰血脂论坛。此外,协助罕见病纯合FH的孤儿药--降脂新药瑞百安在我国上市并参与中华慈善总赠药项目。总之,本项目对于我国FH研究起到积极的推动作用,带来良好的社会效益,对于FH高危人群的早期诊断早期治疗意义重大。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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