适应性进化的基因组学——通过第二代测序技术检测基因组变异

2007年以来，新一代测序技术迅速发展，测序通量提高了1000倍。快速发展和高通量的测序技术，使我们能够设计全基因组分析实验，来解决重要的生物学问题，为生物学研究带来了革命性的技术突破。本研究以生物适应性机制中两个重要的生物学问题- - 肿瘤细胞群体的进化和多倍体鱼类物种的适应性进化为例，通过深度高通量测序，1）分析单核苷酸突变、结构变异等遗传变异，用全新的微观手段和群体遗传的分析方法，探讨体细胞突变和肿瘤细胞的进化特点，同时在全基因组中找出与疾病相关的重要突变，从而为疾病的治疗提供遗传基础资料。2）对裂腹鱼类及其近缘的二倍体物种不同组织的转录组进行测序分析，来研究年轻多倍体裂腹鱼类与其近缘的二倍体物种在转录水平上的差异，揭示年轻多倍体物种基因组中重复基因在转录水平上的演化规律以及裂腹鱼形态变化和环境适应的关系。