延边地区脂联素信号传导通路基因Poly-miRTS与冠心病的相关研究

Yanbian area is a frontier minority region where Han and Korean Chinese are living together with different genetic background and food habits. It has been reported that the incidence of Coronary Artery Disease (CAD) is incresing in Yanbian area, and showing national differences. We have screened 26 adiponectin signaling pathway related poly-miRTS(Difference [(｜??G｜) ≥5.27 kcal/mol] ) from SNP and miRNA database by using predicting software miRSNP. In this study, we will investigate the effect of interaction between poly-miRTS and environment factors to the incidence of CAD, the reoperation rate after one year of percutaneous coronary intervention. Furthermore, we will test the effect of miRNA on target mRNA by using luciferase assay and qRT-PCR, discuss the regulation of miRNA to different genotype, explain the reason of higher incidence of CAD in Korean-Chinese population. This will provide the theoretical basis for early screening of high risk population, primary prevention of CAD, and the early clinical intervention.

延边地区是以汉族和朝鲜族为主要聚居民族的边疆少数民族地区，且不同民族间的遗传背景、生活方式及饮食习惯有很大差异。流行病学调查表明，延边地区冠心病的发病率和死亡率呈逐年升高，存在民族差异。课题组前期应用miRSNP预测软件和NCBI-SNP数据库在脂联素信号传导通路基因中筛选出野生型和变异型等位基因与miRNA结合能差异(｜??G｜)大于5.27kcal/mol的26个Poly-miRTS。因此，本课题设计研究上述Poly-miRTS和环境因素的交互作用对朝鲜族和汉族人群冠心病易感性、经皮冠状动脉介入治疗后1年内再次手术率的影响，并通过荧光素酶检测和qRT-PCR方法鉴定miRNA对靶标的影响，探讨miRNA对不同基因型的调控作用，合理解释冠心病高发的原因，为早期筛选冠心病高危人群、一级预防以及早期临床干预等提供理论基础。

研究背景：课题组前期应用预测软件和数据库筛选出野生型和变异型等位基因与miRNA结合能差异 (|∆∆G|)大于5.27 KJ/mol的26个Poly-miRTS。因此，本课题设计研究上述Poly-miRTS、病毒和环境因素对原发性冠心病易感性、介入治疗后1年生存率和疗效的影响，并通过功能实验鉴定miRNA对靶标的影响，探讨miRNA对不同基因型的调控作用。.主要研究内容：申报中的26个poly-miRTS位点外，利用Regulome-db、NCBI-SNP和Hapmap-SNP数据库，筛选出远程调控因子区域的145个位点，共171个位点，利用Sequenom Mass ARRAY方法对382例第一数据集（191例正常组/191病例组）DNA样品进行基因分型，通过统计学分析发现145个Regulome-SNPs中21个位点有统计学意义。因此，利用另一个382例第二数据集验证第一数据集，通过统计学分析发现9个Regulome-SNPs有统计学意义，7个Regulome-SNPs失去阳性结果。最终利用350多例独立数据集（independent cohort）验证，上述位点，结果发现2个Regulome-SNPs有统计学意义。.重要结果：上述研究中发现的2个位点与冠心病易感性相关，两篇论文投稿中。另外，1个位点与冠心病无病生存率相关，正在进行功能实验。.重要数据：不显示Regulome-SNPs位点，只显示统计结果，无病生存率相关位点，申报专利成功后撰写论文。.科学意义： .本项课题中发现的2个位点可能预测冠心病易感性相关，1个位点很可能预测冠心病无病生存率相关。开发冠心病易感性和无病生存率预测的生物标记物芯片有望取得巨大的社会及经济效益。