延边地区汉族和朝鲜族人群原发性肝癌与其相关Poly-miRTS的关联性研究

Yanbian area is a frontier minority region where Han and Korean Chinese are living together with different genetic background and eating habits. It has been reported that the incidence of Primary Hepatocellular Carcinoma(PHC) is incresing in Yanbian area, and showing national differences. The development of PHC is related to genetic background,virus infection and environment factors. We have screened 26 poly-miRTS(Difference [(｜??G｜) ≥5.27 KJ/mol] ) from SNP and miRNA database by using predicting software like miRanda and RNAhybrid. In this study, we will investigate the interaction of poly-miRTS, virus infection and environment factors to the incidence of PHC, two year survival after interventional therapy and prognosis in Han and Korean Chinese patients. Furthermore, we will test the effect of miRNA on target mRNA by using luciferase assay and qRT-PCR, discuss the regulation of miRNA to different genotype, explain the reason of higher incidence of PHC in Korean-Chinese population. This will provide the theoretical basis for early screening of high risk population, primary prevention of PHC, and the early clinical intervention.

延边地区是以汉族和朝鲜族为主要聚居民族的边疆少数民族地区，且不同民族间的遗传背景、生活方式及饮食习惯有很大差异。流行病学调查发现，延边地区原发性肝癌的发病率呈逐年上升趋势，存在民族差异。现已公认肝癌的发生与遗传、病毒和环境因素密切相关；课题组前期应用miRanda和RNAhybrid预测软件，结合SNP和miRNA数据库筛选出野生型和变异型等位基因与miRNA结合能差异 (｜??G｜)大于5.27 KJ/mol的26个Poly-miRTS。因此，本课题设计研究上述Poly-miRTS、病毒和环境因素的交互作用对汉族和朝鲜族人群原发性肝癌易感性、介入后2年生存率和疗效的影响，并通过荧光素酶检测和qRT-PCR等方法鉴定miRNA对靶标的影响，探讨miRNA对不同基因型的调控作用，合理解释朝鲜族原发性肝癌高发的原因，为早期筛选肝癌高危人群、一级预防以及早期临床干预等提供理论基础。

简单概述，800字以内)：.研究背景：课题组前期应用预测软件和数据库筛选出野生型和变异型等位基因与miRNA结合能差异 (|∆∆G|)大于5.27 KJ/mol的26个Poly-miRTS。因此，本课题设计研究上述Poly-miRTS、病毒和环境因素对原发性肝癌易感性、介入后2年生存率和疗效的影响，并通过功能实验鉴定miRNA对靶标的影响，探讨miRNA对不同基因型的调控作用。.主要研究内容：申报中的26个poly-miRTS位点外，利用Regulome-db、NCBI-SNP和Hapmap-SNP数据库，筛选出远程调控因子区域的121个位点，共147个位点，利用Sequenom MassARRAY方法对382例第一数据集（191例正常组/191病例组）DNA样品进行基因分型，通过统计学分析发现26个Poly-miRTS和121个Regulome-SNPs中11个位点有统计学意义。因此，利用另一个382例第二数据集验证第一数据集，通过统计学分析发现7个Regulome-SNPs有统计学意义，5个Poly-miRTS失去阳性结果。最终利用400多例独立数据集（indepen cohort）验证，上述位点，结果发现5个Regulome-SNPs有统计学意义。结合随访调查信息发现，4个位点与肝癌总生存率相关。.重要结果：上述研究中发现的5个位点与肝癌易感性相关，投稿中。另外，4个位点与肝癌总生存率相关，正在进行功能实验。.重要数据：不显示Regulome-SNPs位点，只显示统计结果，总生存率相关位点，申报专利成功后撰写论文。.科学意义： .本项课题中发现的5个位点可能预测肝癌易感性相关，4个位点很可能预测肝癌生存率相关。开发肝癌易感性和生存率预测的生物标记物芯片有望取得巨大的社会及经济效益。