运用基于mRNA solexa测序技术的数字基因表达谱RNA-Seq分析方法,检测陕北白绒山羊生长期、退行期和休止期次级毛囊的基因差异表达,结合生物信息学分析,筛选与绒山羊次级毛囊周期性发育相关的基因;以筛选的显著差异表达基因为靶基因,构建重组腺病毒RNA干扰载体,转染体外分离培养的生长期、退行期和休止期次级毛囊组织,结合实时定量PCR和Western blot技术,在mRNA水平和蛋白水平上检测靶基因对β-catenin、Shh、Notch-1、TGF-β1、BMP2等调控毛囊发育相关基因mRNA表达丰度和蛋白表达量的影响;运用免疫共沉淀法分析靶基因与β-catenin、Shh、Notch-1、TGF-β1、BMP2等基因的作用关系,探索靶基因在次级毛囊周期性发育过程中的调控作用。旨在揭示绒山羊次级毛囊周期性发育的分子调控机理,为实现人工调控绒毛生长、加快绒山羊遗传育种进展提供理论依据。
运用基于mRNA solexa测序技术的数字基因表达谱RNA-Seq分析方法,检测陕北白绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期的基因差异表达,结合生物信息学方法筛选与绒山羊次级毛囊周期性发育相关的基因。. 研究结果表明:在生长期、退行期和休止期共筛选出1322个差异表达基因,归类为53个功能类群;生长期与退行期、生长期与休止期的基因表达差异都相对较小,退行期与休止期的基因表达差异较大;共有1129个差异表达基因通过KEGG注释到各种生化代谢途径和信号转导途径。通过实时定量PCR检测和免疫组化技术发现,Lhx2基因和MSX2基因对皮肤毛囊周期周期性变化具有一定的调控作用。. 本项目筛选出次级毛囊不同发育时期的差异表达基因,为深入揭示绒山羊次级毛囊周期性发育的分子调控机理奠定了基础,也能够为实现人工调控绒毛生长、加快绒山羊遗传育种进展提供理论依据。
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数据更新时间:2023-05-31
长链基因间非编码RNA 00681竞争性结合miR-16促进黑素瘤细胞侵袭和迁移
陆地棉无绒突变体miRNA的鉴定及其靶标基因分析
毛竹微型颠倒重复序列的鉴定及分子标记开发
拟果蝇钠离子通道基因克隆及其生物信息学分析
转EuCHIT1 基因提高小麦对条锈病的抗性
绒山羊次级毛囊周期性生长相关基因的筛选及作用机制研究
阿尔巴斯绒山羊初级和次级毛囊细胞体外生长模型的建立及次级毛囊发育相关功能基因的筛选
绒山羊次级毛囊发生发育相关基因筛选与作用机制研究
绒山羊次级毛囊周期性发育的microRNA调控机理研究