用dsDNA微阵列筛选NF-κB DNA靶点及靶基因

基本信息
批准号:60871014
项目类别:面上项目
资助金额:35.00
负责人:王进科
学科分类:
依托单位:东南大学
批准年份:2008
结题年份:2011
起止时间:2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:杨锡南,张定东,葛芹玉,李敏俐,沈姗姗,于聘飞,张晨光,刘颖勋
关键词:
MSdsDNAgenesmicroarrayregulatoryNFκBtranscriptionalsitesnetworktargetbinding
结项摘要

本研究运用我们发展的发卡引物在片延伸技术制备含有连续碱基突变的双链DNA 微阵列芯片[MS-dsDNA microarray],考察转录因子NF-κB与众多突变DNA位点的相互作用,筛选出对NF-κB 具有较高亲合性的DNA 位点;再通过对人全基因组序列的扫描,确定这些位点在基因组中的分布图谱(profile),预测其为基因组中NF-κB 的假定结合位点(putative binding sites,PBS);并将这些PBS上下文中分布的基因预测为NF-κB的假定靶基因(target genes);最后通过文献检索和实验验证,鉴定新的NF-κB 功能性(functional)结合靶点和靶基因,构建NF-κB 控制的基因转录调控网络(transcriptional regulatory network),描绘NF-κB 的完整生物学全貌,为NF-κB的生物医学应用提供科学依据。

项目摘要

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

Single-mode millijoule fiber laser system with high pulse shaping ability

Single-mode millijoule fiber laser system with high pulse shaping ability

DOI:10.1016/j.ijleo.2017.11.198
发表时间:2018
2

DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences

DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences

DOI:10.1093/bib/bbab336
发表时间:2021
3

Wearable Electrocardiogram Quality Assessment Using Wavelet Scattering and LSTM

Wearable Electrocardiogram Quality Assessment Using Wavelet Scattering and LSTM

DOI:10.3389/fphys.2022.905447
发表时间:2022
4

Altered Urinary Amino Acids in Children With Autism Spectrum Disorders

Altered Urinary Amino Acids in Children With Autism Spectrum Disorders

DOI:10.3389/fncel.2019.00007
发表时间:2019
5

Dynamic behaviors of protein and starch and interactions associated with glutenin composition in wheat dough matrices during sequential thermo-mechanical treatments

Dynamic behaviors of protein and starch and interactions associated with glutenin composition in wheat dough matrices during sequential thermo-mechanical treatments

DOI:
发表时间:

王进科的其他基金

批准号:60201005
批准年份:2002
资助金额:7.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:61571119
批准年份:2015
资助金额:65.00
项目类别:面上项目
批准号:61171030
批准年份:2011
资助金额:60.00
项目类别:面上项目
批准号:60471019
批准年份:2004
资助金额:23.00
项目类别:面上项目
批准号:90408027
批准年份:2004
资助金额:30.00
项目类别:重大研究计划

相似国自然基金

1

致癌物与DNA形成加合物的基因作用靶点筛选研究

批准号:30170793
批准年份:2001
负责人:唐非
学科分类:H3001
资助金额:19.50
项目类别:面上项目
2

建立以DNA回旋酶B亚基为靶点的抗结核药物筛选模型

批准号:39970021
批准年份:1999
负责人:肖春玲
学科分类:C0104
资助金额:12.00
项目类别:面上项目
3

用cDNA Array分析肿瘤耐药相关基因及抗肿瘤药物新靶点

批准号:30271515
批准年份:2002
负责人:杨纯正
学科分类:H3505
资助金额:18.00
项目类别:面上项目
4

双靶点基于二萜、倍半萜的NF-κB抑制剂的设计合成及活性评价

批准号:81172941
批准年份:2011
负责人:赵昱
学科分类:H3402
资助金额:64.00
项目类别:面上项目