心肌细胞新陈代谢系统中的若干动力学问题

基本信息
批准号:10971152
项目类别:面上项目
资助金额:24.00
负责人:杨凌
学科分类:
依托单位:苏州大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王益,黄浩岳,丰世富,张校荣
关键词:
生物系统新陈代谢网络数学模型心肌细胞非线性动力学
结项摘要

心肌细胞的新陈代谢系统是一个复杂的大网络。在特定条件下,代谢失调会引发一些特殊的行为,例如:1)缺少葡萄糖,ATP会发生周期振荡;2)活性氧会引发线粒体电位振荡,也可引发线粒体去极化(depolarization)的空间慢波;3)预处理可引发奇异的两阶段心脏保护(cardioprotection)现象。上述的复杂行为较难用传统的生物医学方法解释。我们试图用系统生物学的思想和非线性动力学的工具,依托我们在这方面的经验,通过数学模型和计算机模拟,从理论上揭示上述复杂行为的根本机制。.另一方面,由于有效的实验数据馈乏,导致无法确定复杂模型中大量的参数值。而对于有很多变量的复杂模型,理论分析也相当困难。因此,合理约化模型成为生物系统建模的一个核心问题。在本项目中,我们也试图用代谢系统的复杂网络为例子,来研究如何在不损失特定动力学行为(实验所关注的)的前提下,将复杂的数学模型尽量简化。

项目摘要

心肌细胞的新陈代谢系统是一个复杂的大网络。在特定条件下,代谢失调会引发一些特殊的动力学行为。这些复杂行为较难用传统的生物医学方法解释。我们利用系统生物学的思想和非线性动力学的工具,通过数学模型和计算机模拟,从理论上揭示这些复杂行为的根本机制,如:1)缺少葡萄糖时,ATP 发生周期振荡的机制是通过两个Hopf分叉实现的;2)活性氧所引发线粒体电位振荡与mitochondrial inner membrane anion channels (IMAC)相关的,而其引发线粒体去极化(depolarization)的空间慢波则与mitochondrial permeability transition pore (MPTP) 相关的,其背后的动力学机制则与Hopf 分叉和双重稳定态有关;3)预处理所引发奇异的两阶段心脏保护(cardioprotection)现象中的生物学“记忆”的机制是正反馈引发的双重稳定态。除此之外,我们还进一步对本课题紧密相关的一些生物调控网络,例如细胞(分裂)周期、生物钟等系统做了研究并取得一定的成果。.另一方面,由于有效的实验数据馈乏,导致无法确定复杂模型中大量的参数值。而对于有很多变量的复杂模型,理论分析也相当困难。因此,合理约化模型成为生物系统建模的一个核心问题。在本项目中,我们也用代谢系统的复杂网络为例子,研究了由复杂的数学模型简化后的低维反馈环的动力学行为。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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