新策略化学合成膜蛋白及其动态生物物理研究

基本信息
批准号:21402206
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:25.00
负责人:郑基深
学科分类:
依托单位:中国科学院合肥物质科学研究院
批准年份:2014
结题年份:2017
起止时间:2015-01-01 - 2017-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:周鹏,余木,刘三玲,梁军,郑勇
关键词:
膜蛋白化学合成蛋白质翻译后修饰Ser/Thr位点可逆骨架修饰动态生物物理研究定点同位素标记
结项摘要

Chemical synthesis of membrane proteins can acess a protein with any desired function (such as isotope-labelled and post-translationally modified proteins). Its broad application prospects include the drug discovery and structure-function relationship studies of membrane proteins. The most promising method of chemical synthesis of membrane proteins is glycine-based reversible backbone modification (RBM) strategy. A common required element of the RBM strategy is a glycine residue at the modification site. To extend RBM strategy of membrane proteins to non-Gly sites, the project will attempt to achieve the following goals: (1) Development of reversible backbone modification strategies at Ser/Thr sites using O-to-N acyl shift or new amino-protecting groups; (2) Synthesis of the HIV-1-specific Vpu protein to verify the applicability of the new strategy; (3) Synthesis of phosphorylated Vpu by the new method to discover new roles of those phosphorylations; (4) Measuring NMR spectra to find the cross-talking of these phosphorylations of 13C-labelled Vpu. Those new methods would enable introducing reversible backbone modification at non-glycine sites to expand the scope of membrane protein synthesis and allow incorporation of specific isotope labeling into membrane proteins for dynamic biophysical studies.

化学合成膜蛋白能够得到特定功能的膜蛋白(例如同位素标记和翻译后修饰),在药物研发和蛋白结构-功能研究等领域具有巨大应用前景。目前,化学合成膜蛋白的有效方法是可逆主链骨架修饰策略。但是,该策略仅限于Gly位点引入,这极大限制了该策略的推广使用。为突破这一限制,本项目拟计划:(1) 通过“O-to-N”酰基迁移或发展新型氨基保护基手段,在Ser/Thr这两个位点实现可逆骨架修饰策略;(2) 为验证新策略的有效性,化学合成HIV-1型的Vpu膜蛋白;(3) 利用新策略,合成磷酸化修饰及13C标记定点的膜蛋白Vpu,探索膜蛋白Vpu不同位点的磷酸化修饰的新功能;(4)通过测定核磁共振信号,获得Vpu磷酸化翻译后修饰的相互作用关系。通过本项目执行,期望发展一种Ser/Thr位点引入可逆骨架修饰策略,实现膜蛋白的高效化学合成。同时,利用新策略合成定点同位素标记的膜蛋白,用于动态生物物理研究。

项目摘要

化学合成膜蛋白能够得到特定功能的膜蛋白(例如同位素标记和翻译后修饰),在药物研发和蛋白结构-功能研究等领域具有巨大应用前景。目前,化学合成膜蛋白的有效方法是可逆主链骨架修饰策略。但是,该策略仅限于Gly位点引入,这极大限制了该策略的推广使用。为突破这一限制,本项目的主要内容包括:(1)利用“O-to-N 酰基迁移”策略等,设计、优化合成新型骨架修饰结构单元,进行膜蛋白化学合成新方法的发展和探索;(2)利用新发展的膜蛋白合成新策略,进行了定点标记、翻译后修饰等膜蛋白样品的化学合成;(3)利用化学合成得到的蛋白质探针分子,研究了膜蛋白结构和功能。获得的成果包括:(1)发展了新的膜蛋白化学合成方法,为化学合成含定点标记的膜蛋白质提供有效技术;(2)使用膜蛋白合成新技术和方法,制备定点同位素标记的丙型肝炎病毒HCV的离子通道蛋白p7,获得p7离子通道膜蛋白与金刚烷胺抑制剂的结合位点信息;(3)发展靶向膜蛋白的蛋白质探针,阐释膜蛋白介导的细胞动态过程。在本项目的资助下,共发表了J. Am. Chem. Soc.、Nat Protocols、Acc. Chem. Res.等SCI论文14篇,其中项目负责人为第一作者的论文1篇,项目负责人为通讯作者的论文12篇。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

涡度相关技术及其在陆地生态系统通量研究中的应用

涡度相关技术及其在陆地生态系统通量研究中的应用

DOI:10.17521/cjpe.2019.0351
发表时间:2020
2

一种光、电驱动的生物炭/硬脂酸复合相变材料的制备及其性能

一种光、电驱动的生物炭/硬脂酸复合相变材料的制备及其性能

DOI:10.16085/j.issn.1000-6613.2022-0221
发表时间:2022
3

宁南山区植被恢复模式对土壤主要酶活性、微生物多样性及土壤养分的影响

宁南山区植被恢复模式对土壤主要酶活性、微生物多样性及土壤养分的影响

DOI:10.7606/j.issn.1000-7601.2022.03.25
发表时间:2022
4

内点最大化与冗余点控制的小型无人机遥感图像配准

内点最大化与冗余点控制的小型无人机遥感图像配准

DOI:10.11834/jrs.20209060
发表时间:2020
5

疏勒河源高寒草甸土壤微生物生物量碳氮变化特征

疏勒河源高寒草甸土壤微生物生物量碳氮变化特征

DOI:10.5846/stxb201912262800
发表时间:2020

相似国自然基金

1

膜蛋白构象的生物物理研究

批准号:39330070
批准年份:1993
负责人:林克椿
学科分类:C10
资助金额:50.00
项目类别:重点项目
2

动态投资组合新策略及其实证分析方法研究

批准号:70371010
批准年份:2003
负责人:劳兰珺
学科分类:G0114
资助金额:15.00
项目类别:面上项目
3

翻译后修饰IFITM3膜蛋白的化学合成及其抗病毒活性调控机制

批准号:91753120
批准年份:2017
负责人:郑基深
学科分类:B0702
资助金额:70.00
项目类别:重大研究计划
4

毒素蛋白探针的化学合成及其生物学应用

批准号:21572043
批准年份:2015
负责人:李宜明
学科分类:B0702
资助金额:30.00
项目类别:面上项目