翻译后修饰IFITM3膜蛋白的化学合成及其抗病毒活性调控机制

基本信息
批准号:91753120
项目类别:重大研究计划
资助金额:70.00
负责人:郑基深
学科分类:
依托单位:中国科学技术大学
批准年份:2017
结题年份:2020
起止时间:2018-01-01 - 2020-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:凌盛龙,梁军,肖亮,王国富,龚清跃
关键词:
膜蛋白化学合成翻译后修饰蛋白质和多肽化学生物学干扰素诱导抗病毒蛋白IFITM3抗病毒活性调控机制
结项摘要

Interferon-induced transmembrane protein 3 (IFITM3) restricts cellular infection by multiple important viral pathogens. The antiviral activity of the small transmembrane protein (133 amino acid) is controlled by at least four distinct post-translational modifications (S-palmitoylation, lysine ubiquitination, lysine methylation and tyrosine phosphorylation). Further studies of the influence of posttranslational modifications on antiviral activity require for efficient methods to provide the homogeneous IFITM3 material containing site-specifically posttranslational modifications. In this project, the combinations of chemically selective ligation reaction, covalent cross-linking, mass spectrometry, liposome membrane fusion and engineering hybrid exosomes will be performed to achieve the following goals: (1) the efficient preparation of post-translationally modified IFITM3 protein samples and their probes; (2) the discovery and identification of specific interacting proteins of the modified IFITM3; and (3) the interpretation of the dynamic regulatory mechanism of post-translational modification for the antiviral activity.

干扰素诱导的跨膜蛋白质3(Interferon-induced Transmembrane Protein 3,IFITM3)具有重要的抗病毒感染的能力。 IFITM3是含133个氨基酸的小膜蛋白质,它的抗病毒活性通过棕榈酰化、泛素化、磷酸化和甲基化等至少四个不同的翻译后修饰来调控。为进一步研究这些翻译后修饰的抗病毒活性机理,需要发展定点翻译后修饰IFITM3蛋白样品的高效获取方法。本项目将以高选择性化学连接反应为技术手段,结合共价交联、质谱分析、脂质体融合及人工设计外泌体技术等,实现的目标包括:(1)高效制备定点翻译后修饰的IFITM3 蛋白样品及其探针;(2)发现鉴定特异性相互作用蛋白;(3)阐释翻译后修饰的动态调控过程的作用机制。

项目摘要

干扰素诱导的跨膜蛋白(Interferon-induced Transmembrane Proteins, IFITMs)是一类具有广谱抗病毒能力的蛋白质。其中IFITM3的抗病毒能力最强,作用范围最广,能够抑制多种病毒入侵和复制,包括 HIV-1、DENV、EBOV和Zika 等。IFITM3的翻译后修饰(S-棕榈酰化(S-Palm)、泛素化、磷酸化和甲基化等)能够调控抗病毒活性,但翻译后修饰对IFITM3的抗病毒活性调控的机理仍然不明确。为此,需要获取特定位点修饰的IFITM3蛋白样品,用于相关生物化学、生物物理及生物医学研究。但是,高效获取定点翻译后修饰IFITM3膜蛋白依然十分困难。以S-棕榈酰化的IFITM3合成为例,通过生物方法难以获得均一样品。化学方法获取该修饰蛋白也存在挑战,这是因为两方面原因:首先,S-Palm膜蛋白极为疏水,合成操作过程困难;其次,S-Palm修饰的硫酯键非常活泼,与自然化学连接(NCL)等反应条件不兼容。.为此,本项目发展了基于新型自环化酚羟基保护基γ-氨基丁酸(GABA)的可移除骨架修饰策略(RBMGABA)辅助的丝/苏氨酸连接(Removable-Backbone-Modification Assisted Ser/Thr Ligation, RBMGABA-assisted STL) 技术,使用该技术实现了S-Palm跨膜肽片段的高效连接。同时,发展了一种新的 1,3-丙二硫醇(1,3-Propanedithiol,PDT)保护的水杨醛(Salicylaldehyde,SAL)酯(SALPDT)结构,该结构与NCL反应条件兼容,且在NCL反应结束后可活化为有STL反应活性的SAL-酯。基于此,我们开发了N-to-C 顺序的 NCL 和 STL 结合策略(NCL-STL),实现了133个氨基酸的S-Palm IFITM3膜蛋白的顺利获取。利用新策略,我们成功地实现了S-Palm IFITM3样品的制备。新的RBMGABA-assisted STL) 技术和NCL-STL组合连接策略为获取更大、更复杂的多翻译后修饰IFITM3及其探针提供了有效途径,进一步探索S-Palm 修饰及去修饰的IFITM3相互作用蛋白、S-Palm与其他翻译后修饰之间的相互影响以及解析S-Palm IFITM3膜蛋白结构提供了研究工具。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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