采用染色质免疫沉淀策略鉴定肝病关联基因rSNP的功能

对于常见疾病的遗传易感性，目前的疾病关联研究很多，功能位点的鉴定较少；编码区SNP功能研究较多，调控区SNP功能研究相对薄弱。我们采用连锁不平衡-关联研究的策略已确定雌激素受体α（ESR1）和CXCL10基因多态性与慢性HBV感染及其疾病进程相关，疾病关联SNP位点位于基因转录调控区。染色质免疫沉淀技术(ChIP)是近几年来发展的一种高通量的DNA-蛋白相互作用研究技术，且能在维持染色质天然结构状态下研究基因启动子区的转录活性。本研究拟采用RNA多聚酶II-ChIP和多重引物延伸-飞行时间质谱技术，扫描ESR1/CXCL10及IL-6、IL-10、TNF-α等肝病关联基因调控区SNP位点的等位特异性磷酸化RNA多聚酶II结合量，以确定影响疾病的调节性SNP（regulatory SNP, rSNP）位点及其调控通路，并为生理状态下其他基因rSNP的高通量鉴定提供思路。