长链非编码RNA ENST00000454471对关键基因表达的调控在结直肠癌发生发展中的作用及机制

基本信息
批准号:81401930
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:21.00
负责人:陈巍峰
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2014
结题年份:2017
起止时间:2015-01-01 - 2017-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李全林,高卫东,侯嘉云,何梦江,胡健卫,张晨,陈天音,朱俊宇
关键词:
长链非编码RNA直肠肿瘤C08_结肿瘤发生发展
结项摘要

Several studies have indicated that long non-coding RNA (lncRNA) may play an important role in tumorigenesis and progression of colorectal caner (CRC), but the underlying mechanisms remain elusive. In addition, a lot of related lncRNAs have not been revealed due to the variety and complexity. Our preliminary studies: ①screened lncRNAs expression profile in the normal epithelium, adenoma, and CRC tissues using high throughput microarrays, and identified ENST00000454471 as a distinguishing lncRNA closely associated with tumorigenesis;②ENST00000454471 knock-down suppressed tumor proliferation, migration and invasion, while induced tumor apoptosis. In this study, we aim to:①retro-regulate the expression of ENST00000454471 and investigate its role on malignant activity in both adenoma and adenocarcinoma cells;②screen the interacted proteins and specific DNA banding loci of ENST00000454471 using expression profile microarrays, CHIRP-Seq, RNA pull down, CHIP and other approaches; thus, clarify the underlying molecular mechanisms of ENST00000454471 on gene expression; ③ establish and validate a prediction model based on the expression level of ENST00000454471. This study could further provide a potential molecular marker and therapeutic target for prevention, early detection and treatment of CRC.

有研究提示多个长链非编码RNA(lncRNA)与结直肠癌发生发展相关,但其调控机制远未阐明。同时仍有大量相关lncRNA未被发现。我们前期:①通过高通量芯片在“正常-腺瘤-进展期癌”中筛选并验证出了ENST00000454471这一特征性差异表达的lncRNA;②功能实验揭示ENST00000454471可促进腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,抑制凋亡。在此基础上,我们拟:①在结肠腺瘤和腺癌细胞中,反向调控ENST00000454471表达,体内外实验观察对肿瘤恶性行为能力的影响;②应用表达谱芯片、CHIRP-Seq、RNA pull down 、CHIP和高通量测序等技术,探索ENST00000454471相互作用的关键蛋白和特异基因结合位点,绘制出其调控键基因表达的分子信号网络图;③以ENST00000454471表达构建预后预测模型。由此为肿瘤预防和早诊早治提供新的分子标记及潜在治疗靶点。

项目摘要

研究背景:有研究提示多个长链非编码RNA(lncRNA)与结直肠癌发生发展相关,但其调控机制远未阐明。同时仍有大量相关lncRNA未被发现。我们前期:1)通过高通量芯片在“正常-腺瘤-进展期癌” 中筛选并验证出了ENST00000454471这一特征性差异表达的lncRNA;2)功能实验揭示ENST00000454471可促进腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,抑制凋亡,但其具体机制尚不清楚。.研究目的:阐明lncRNA ET471在结直肠癌侵袭转移中扮演的角色及相关分子机制。.主要研究结果:①lncRNA ET471在“正常结直肠上皮-腺瘤-腺癌”这一经典的肠癌发病过程表达呈逐渐上升趋势;体内外研究显示ET471可促进结直肠癌生长和侵袭。②与非肿瘤组织相比,在结直肠腺瘤和癌中,miR-214的表达水平显著下调,ET471和miR-214之间有明显的负相关性,体内外研究显示miR-214通过负调控lncRNA ET471表达,从而调节结直肠肿瘤的侵袭转移。③生物素-亲和素拉下试验等研究结果示miR-214通过竞争ET471序列中的miRNA结合位点抑制结直肠肿瘤进展,提示了miR-214在调控网络中可能的作用机制。.结论及意义:本项目证实了lncRNA ET471可促进结直肠肿瘤的生长和侵袭,miR-214通过负调控lncRNA ET471表达,从而调节结直肠肿瘤的侵袭转移,并通过竞争ET471序列中的miRNA结合位点抑制结肠肿瘤进展。该成果有望作为结直肠癌预防和靶向干预的靶点。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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