新的寻常型鱼鳞病致病基因的精细定位与克隆

基本信息
批准号:30972655
项目类别:面上项目
资助金额:30.00
负责人:刘静宇
学科分类:
依托单位:华中科技大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:杨擎宇,陈迪,高勇,徐寒阳,温景敏,王程
关键词:
新基因克隆精细定位寻常型鱼鳞病
结项摘要

寻常型鱼鳞病(ichthyosis vulgaris,IV)是最常见的一种皮肤角质化紊乱疾病,具有遗传异质性。至今仅在1q上发现1个FLG基因的一些功能性突变与部分IV发生有关,最新研究表明,该基因在各类皮肤障碍的致病机制中起修饰作用。因此存在着重要的IV致病基因尚未被克隆。本课题组对2个IV家系进行连锁分析,定位了第二个IV致病区域10q22.3-24.2,获得最大LOD值是3.95,连锁距离大约20.4Mb。该区域有122个候选基因,110个EST,进行致病基因的突变检测不切实际。该研究将在鉴定的其他家系中或在上述连锁区域两端选用SNPs标记进行连锁分析缩短连锁距离,并选择合适候选基因进行克隆,同时在其他IV家系和散发病人中对新克隆基因进行突变检测;根据该基因结构特点确定研究其功能方法,阐明该基因的突变如何引起表皮角质层过度角化的病理生理机制。

项目摘要

寻常型鱼鳞病(ichthyosis vulgaris,IV)是最常见的一种皮肤角质化紊乱疾病,常表现常染色体显性遗传(AD),具有遗传异质性。目前仅发现两个基因突变与IV相关,1个FLG基因的一些功能性突变与部分ADIV发生有关,新近研究表明,该基因在各类皮肤障碍的致病机制中起修饰作用;另一个是LIPN基因的2bp缺失突变与迟发型常染色体隐性遗传(AR)IV有关。因此利用中国丰富的遗传病家系资源,收集更多的遗传性IV大家系克隆具有我国知识产权的IV致病基因,对阐明IV致病机制有重要的科学意义。.本研究收集与鉴定了30个IV家系, 407例散发IV病例和384例正常对照样本。将四个ADIV家系的致病基因定位在同一个区域D10S201和D10S571之间(10q23.2-24.2)大约16.12Mb。该连锁区域中有100个候选基因和30个EST,对其中1个家系先证者进行外显子组和Sanger测序,发现两个可疑基因的改变与该家系疾病共分离;同时对其他三个家系测序,其中1个基因在两个家系中发现可疑改变,这些改变也分别与对应的家系疾病共分离,未发现另一个基因突变;1个可疑基因的三个碱基改变在千人基因组计划中的MAF值均小于0.01。推测该基因可能是ADIV一个新的致病基因,有关功能分析正在研究中。在该项目的资助下同时对其他疾病如粘质累积病、成骨发育不全、家族性基底节钙化等遗传病的致病原因进行研究,发现相关的致病原因。在该项目的资助下,发表5篇SCI论文(其中1篇发表在国际顶级杂志“Nature Genetics”上)和1篇核心期刊文章及多篇国内会议论文摘要。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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