类别驱动的RNA二级结构预测方法研究

生物学研究已经证实某些RNA二级结构具有规律性典型结构，而目前的RNA二级结构预测方法将所有RNA统一处理。为此，本项目将RNA中具有典型二级结构和其它无明显特征的二级结构相区别，提出基于类别驱动的RNA二级结构预测方法。该方法优先预测某些RNA的典型二级结构，然后预测其剩余部分或其它类别RNA的二级结构。为了模拟RNA分子的实际折叠过程，降低算法复杂度，分别提出基于集合和置换个体表示的两种遗传算法的预测方法，并研究与生物学背景知识相一致的遗传操作算子。在此基础上，设计合理的类别驱动RNA二级结构预测软件系统，以避免目前其它方法的预测结果缺乏领域知识指导的缺点。因而，本项目研究在信息科学与生命科学相结合方面具有特色，有一定的理论价值和较大的应用前景。