应用最大似然法和计算机模拟技术重建泛素及相关修饰蛋白超家族序列、结构与功能的进化关系

基本信息
批准号:30871391
项目类别:面上项目
资助金额:8.00
负责人:王莉
学科分类:
依托单位:上海市生物医药技术研究院
批准年份:2008
结题年份:2009
起止时间:2009-01-01 - 2009-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:长谷川政美,韩利平,金科,段晓阳,应贝丽,沈灵犀
关键词:
进化重建最大似然法泛素计算机模拟修饰蛋白
结项摘要

泛素(ubiquitin)及相关修饰蛋白超家族(ubiquitin-related supfamily modifier)在细胞凋亡、代谢调节、蛋白监控、免疫应答、信号传递、转录控制、DNA修复等一系列生命活动中均发挥着重要作用。目前,围绕泛素超家族的进化起源,及其序列、结构和功能间的进化关联还存在许多富有挑战性的科学问题。本项目在对该超家族成员Urm1的结构及修饰蛋白的进化起源分析基础上,拟进一步整合泛素及相关修饰蛋白超家族的序列、结构和功能信息,应用最大似然法和计算机模拟技术,重建它们的进化模式,发展新的氨基酸置换模型和统计算法,检测细胞泛素化过程中的适应性进化,并与分子生物学及合作,对部分重要的功能模式进行实验验证。为开展复杂蛋白超家族的序列、结构和功能进化研究提供新的生物信息技术平台。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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