新型自剪切类核酶Pistol的结构与催化机制研究

基本信息
批准号:31670826
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:任艾明
学科分类:
依托单位:浙江大学
批准年份:2016
结题年份:2020
起止时间:2017-01-01 - 2020-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:余志强,郑路倩
关键词:
RNA茎环结构RNA假结结构核酶RNA催化
结项摘要

Small self-cleaving ribozymes were discovered more than 30 years ago, each ribozyme family has its distinct structure and unique catalytic center. Three new small self-cleaving ribozymes were identified recently including twister-sister, pistol and hachet. Pistol ribozyme is the smallest one, but is also the only one with pseudoknot scaffold structure. So how does the RNA molecules fold into a stable three-dimension structure? How does the structure catalyze the cleavage reaction? Which nucleotides play the key roles in cleavage reaction? Is there any Mg2+ or small molecule involved in the reaction? And what’s the potential application of the new ribozymes? To answer these questions, we will launch a comprehensive study of the structure and catalytic mechanism of pistol ribozyme using x-ray crystallography method and the related functional study methods.

小的自身剪切类核酶(50到150个碱基)发现于30多年前,已发现的每类核酶都具有不同的结构特征和独特的催化中心。最近报道的三类新型小的自身剪切类核酶twister-sister, pistol和hachet中,Pistol核酶是其中最小,但却唯一带假结结构的核酶。那么它是如何折叠形成稳定的核酶结构?该结构又是如何促进酶切反应的进行?哪些核苷酸起着关键作用?有没有Mg2+或其他小分子化合物参与到反应中以及该核酶又具有哪些应用前景?这些问题都尚未得到解决。在本项目中申请人将通过x-射线晶体学的方法以及相关的功能实验开展对新型核酶pistol的结构与催化机制研究;在此基础上,还将对其生物功能以及潜在的应用前景进行探讨。

项目摘要

小的自身剪切类核酶(50到150个碱基)发现于30多年前,已发现的每类核酶都具有不同的结构特征和独特的催化中心。最近报道的三类新型小的自身剪切类核酶twister-sister, pistol和hachet中,Pistol核酶是其中最小,但却唯一带假结结构的核酶。在本项目中申请人通过x-射线晶体学的方法解析了新型核酶pistol的三维结构,以结构为基础,结合相关的功能实验全面解析了pistol核酶的催化机制。此项工作为研究RNA分子的结构特征与功能关系提供了重要的结构信息; 为开发Pistol核酶在医学、药学等方面的应用提供了一定的理论依据;同时也为“RNA世界起源说”提供了强有力的支持。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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