基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的新方法

一种基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法。本研究中双链DNA序列作为输入分子，由限制性内切酶对DNA进行切割，露出粘性末端，与状态转移分子通过碱基配对相结合并发生连接。由于状态转移分子仍然含有限制性内切酶的识别位点，连接后的DNA分子继续新一轮的切割和连接循环并使作为输入分子的DNA序列逐渐变短，作为输入分子的DNA序列逐渐变短，输入分子的长度变化反映了DNA序列的信息，该长度变化是可阅读的，通过设计状态转移分子的结构可以实现输入分子的长度递减的速度为每次1个碱基，从而实现测序。本研究将有效地避免单链DNA分子高级结构引起的测序困难，克服现有技术中单链模板二级结构影响测序的不足，并在此基础上降低成本。国际上尚无人提出用DNA计算的思想来测定DNA序列。我们是首次提出该策略并已申请专利；初步研究表明该策略有很大的潜在应用前途，值得立即进行技术攻关、完善并考量其实用价值。