中国人HLA全区域序列分析及其在自身免疫性疾病基因定位中的应用

HLA区域基因在机体的免疫系统中起着重要的作用，HLA的多态性决定了机体的免疫能力差异，系统地研究该区域的多态性，鉴定其SNPs和单倍型将对致病基因的寻找、疾病诊断及治疗等提供宝贵资料；研究该区域的进化问题将对新基因的发现、基因功能的阐释具有重要的作用，甚至探讨我国人群的起源问题。现在对该区域的研究基本上都是来自高加索人，仍然缺少对我国群体的研究，由于我国群体和西方人群的遗传差异，系统地研究我国群体多态性将具有重要的意义。本课题拟采用长链PCR扩增中国群体HLA全区域大约4M bp的片段，应用454测序仪测序，利用生物信息学、群体遗传学等工具研究该区域在中国人群中的多态性，鉴定中国人群所特有的SNPs及单倍型，分析该区域所受进化压力和自然选择情况；并利用该信息构建适合中国人群的HLA区域tagSNPs图谱，以强直性脊柱炎为例将来阐明HLA全区域多态形与疾病的关系，并作为系统研究的示范。