基于深度测序的非小细胞肺癌侵袭与转移特异性表达调控机制的研究

基本信息
批准号:81172006
项目类别:面上项目
资助金额:70.00
负责人:罗泽伟
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:吴小萍,陆晨琪,王路雯,方欧,袁慧,阮培峰
关键词:
深度测序侵袭和转移miRNA转录组肺癌
结项摘要

肺癌是一种发病率持续增高的恶性肿瘤,肺癌细胞高频率地近端侵袭及远端转移是导致患者死亡的主要原因。揭示癌细胞侵袭与转移过程特异性基因表达调控机制是一项极具挑战性的、成功率极低的研究工作。深度测序为认识基因组结构与功能提供了视角更广、解析率更高的实验分析手段。然而,深度测序由于其昂贵的费用,仍然不可能应用于群体水平的研究。为克服这一瓶颈,本项研究建议混合样本测序的基本策略,并展开由此产生的实验设计、数据分析的理论与方法学研究。同时将这一研究方法应用于不同类型非小细胞肺癌组织与相应癌旁组织的DNA、RNA以及microRNA混合样本的深度测序实验分析,进而寻找并验证与肺癌侵袭和转移能力密切相关的、新的特异性基因结构、表达剪切、miRNA变异类型等。本项研究不仅可以为深入认识非小细胞肺癌细胞侵袭与转移过程提供有价值的高解析率科学数据,也为深度测序在同类实验研究中的应用提供新的科学分析方法。

项目摘要

肺癌是恶性肿瘤中死亡率最高的癌症,在全球每年有超过一百万病人死于肺癌。目前中国已是世界第一肺癌大国,而且发病率仍呈不断上升的趋势。80%肺癌患者就诊时已属于晚期,5年生存率不到15%。为了提高肺癌的早期诊断效率,准确地判断肺癌的病理分期,较为科学地评判预后效果,本项目致力于识别和鉴定miRNA类肺癌分子标志物并阐明其分子调控机制。围绕此目标,我们结合新一代RNA测序技术和细胞、分子生物学分析方法,开展了一系列系统、深入的实验研究工作和相关实验数据分析的方法学研究工作,取得了几个突出的研究成果,相关研究成果发表在国际著名的肿瘤学期刊 Oncogene(Wu XP et al, 2013)以及 Oncotarget (Wu et al 2015)。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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