中国汉族卵巢早衰患者全基因组关联分析和拷贝数变异研究

基本信息
批准号:81000236
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:秦莹莹
学科分类:
依托单位:山东大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:游力,高选,孙梅,曲中玉,陈新霞,赵志艺
关键词:
拷贝数变异全基因组关联分析发病机制卵巢早衰
结项摘要

卵巢早衰(Premature Ovarian Failure,POF)是指女性40岁之前因性腺功能衰竭出现绝经,发病率约1%。POF不但导致不孕,而且增加了罹患骨质疏松和冠心病的危险,临床治疗效果不理想。POF发病机理尚不清楚,目前遗传学病因研究以单个候选基因测序分析为主,但致病基因突变发生频率只有1%-2%,半数以上的患者属病因不清的特发性POF。DNA芯片的推广和全基因组扫描、分析技术的成熟,为POF遗传学病因研究提供了一种高通量、高效率的技术平台和载体。本项目拟利用Affymetrix SNP6.0芯片,对400例中国散发型、特发性POF病例进行全基因组扫描,通过全基因组关联分析(GWAS)和拷贝数变异(CNVs)研究,发现新的POF相关基因和热点区域,阐明CNVs在POF发病中的意义,为今后深入研究遗传学发病机理奠定基础。

项目摘要

建立包含详尽临床资料、卵巢组织、外周血以及相应的DNA和RNA卵巢早衰资源库。首次完成大样本中国汉族POF患者染色体核型分析,证实X染色体核型异常是POF的重要病因之一。利用Affymetrix SNP6.0芯片完成国际上迄今为止首个大样本POF GWAS研究,研究发现新的包含8个易感SNPs的POF易感位点-8q22.3,虽属非基因区,但可能存在重要的但尚未明确的远距离调控元件影响卵子发生。首次在POF中进行与早绝经和自然绝经年龄相关位点的关联分析,发现ESR1、BRSK1、HK3基因可能参与POF的发生,提示部分POF与早绝经具有相似的遗传易感性,为家族性POF或早绝经病例的病因研究提供了新的方向。开展国际合作,验证在中国汉族POF GWAS中发现的易感位点与塞尔维亚POF患者的相关性,结果显示二者没有显著相关性,提示POF遗传学病因存在高度的种族差异性。首次在中国汉族POF人群中筛选SKP2,P27,DMC1等基因突变情况,未发现新发基因变异,提示SKP2、P27及DMC1基因突变不是POF的主要发病机制。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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