在此申请中,我们将通过DNA序列设计,构建几种具有选择性粘性末端的Y形DNA组件,通过分步组装的方法用各组件构建全部由DNA大分子构成的树形高分子结构。其中我们将在DNA树形高分子骨架中引入pH值变化驱动的DNA马达单元,从而实现构建的DNA树形高分子尺寸可以通过马达运动被原位改变,为研究树形高分子的性质提供新的模型。我们将利用凝胶电泳、圆二色光谱、激光光散射、透射电镜等手段对构建的DNA树形高分子进行表征并进一步研究其特性;为探索尺寸可调控的树形高分子在药物控制释放中的应用打下基础。
在此项目中,我们完成了申请中的计划内容:成功地设计与合成DNA序列,构建Y形DNA 组件,通过分步组装的方法用各组件构建全部由DNA大分子构成的树形高分子结构。经过多次优化组装条件,获得具有高产率,高纯度的DNA树形分子。为了赋予DNA树形分子的响应性,我们在DNA序列设计上引入具有酸碱响应的i-motif序列,并通过碱基互补配对组装到树形分子骨架中。当pH值变化时,i-motif序列会收缩(四链结构)和伸展(单链结构),从而驱动DNA骨架发生形变,实现构建的DNA树形高分子尺寸可以通过马达运动被原位改变,为研究树形高分子的性质提供新的模型。我们利用凝胶电泳、圆二色光谱、激光光散射等多种手段对构建的DNA树形高分子进行表征,为探索尺寸可调控的树形高分子在药物控制释放中的应用打下基础。
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数据更新时间:2023-05-31
DNAgenie: accurate prediction of DNA-type-specific binding residues in protein sequences
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