基于信息整合方法系统分析拟南芥基因型与表型的关联

利用信息整合技术建立一个研究拟南芥基因型和表型相关性的综合系统平台。通过收集表型突变体信息和生态型研究信息，整理拟南芥突变体的表型并扩展表型分类标准，完善植物本体（Plant Ontology）分类系统，建立一个数据全面，标准规范的拟南芥表型资源数据库。同时结合生态型(Ecotype)中SNP位点信息，以及在个体分子水平上明确的突变体基因型(Genotype)与表型(Phenotype)的关联，整合我们已构建的拟南芥蛋白质相互作用网络和基于拟南芥基因表达谱所建立的基因调控网络，探索基因跟表型的关联。根据分子网络的拓扑学结构，并结合已知表型信息和生态型数据来分析基因的新功能，预测未知基因功能，提供一套系统研究基因功能和形成植物表型机制的分析工具。

通过对拟南芥表型变化突变系进行收集整合，结合己有的表型注释资料和相关的突变表型图片资源，借鉴突变体研究机构分类标准和植物本体（Plant Ontology）分类标准，辅以定量描述参数，对已有表型资源进行系统的分类注释。同时，对影响表型的基因集进行功能富集分析，并整合已构建的拟南芥蛋白质相互作用网络，进一步证明相同表型的基因群在功能模块上的一致性。另外，通过构建并注释整体基因型(Genotype)与表型(Phenotype)关系网络，表型与表型关系网络，建立研究基因型与表型间关系的研究方法。通过对分子网络拓扑结构等信息的分析，进一步发现了一些新的基因型与表型的关系，探索了新的基因的功能，为植物的育种等打下基础。