繁殖类微阵列实验的元分析及猪繁殖机理研究

基本信息
批准号:30871782
项目类别:面上项目
资助金额:36.00
负责人:潘玉春
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2008
结题年份:2011
起止时间:2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王起山,张向喆,胡艳玲,赵洪波,王明辉
关键词:
微阵列元分析繁殖性能候选基因
结项摘要

微阵列(microarray)已成为在基因组水平研究基因表达的最有力工具。但是现有实验存在下列特点:一是多集中于模式生物(例如小鼠、大鼠)和人,而在猪等其它动物方面却因芯片技术平台(platform)尚未完善、成本昂贵等而没有广泛开展;二是几乎都存在着样本数太小的问题,但在模式生物和人方面对于相同问题经常存在许多重复或者类似研究。鉴于猪的繁殖性能意义重大,而现有之QTL定位和候选基因分析进展缓慢,本研究拟首先以GEO和arrayexpress数据库中已有模式生物和人等的繁殖相关微阵列数据作为基础,运用元分析(meta-analysis)法对类似研究进行统计上的整合分析,以在基因组水平上研究繁殖机理- - 挖掘相关基因、追踪调控网络。然后,再用元分析的结果,针对猪的繁殖性能有的放矢地挖掘其相关基因,并对这些基因间的相互作用进行分析。这一研究将为探明动物经济性状的分子遗传机制提供一条新的途径。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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