自交不亲和信号传递因子ARC1相互作用蛋白的筛选及功能分析

基本信息
批准号:30900115
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:18.00
负责人:蓝兴国
学科分类:
依托单位:东北林业大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:张旸,闫海芳,杨佳,吴委林,王江,王艳红,赵昕
关键词:
自交不亲和性蛋白质相互作用酵母双杂交ARC1
结项摘要

自交不亲和性(SI)是植物采取的一种避免自交的策略,在长期进化过程中具有重要的作用。芸苔属SI反应的主要部位是柱头乳突细胞。当花粉中的SCR配体与柱头中的SRK受体特异性地识别后,激活SRK的胞内激酶域。ARC1,一个具有U-Box结构域的E3泛素连接酶,是SRK下游的一个正向调控因子,特异性地识别某些下游底物,通过26S蛋白酶体将其降解从而导致SI反应,但目前ARC1的下游底物尚不清楚。在本项研究中,通过构建柱头的酵母双杂交cDNA文库,利用酵母双杂交系统筛选ARC1相互作用的蛋白质;通过RACE方法获得基因全长并进行序列及表达分析;通过免疫共沉淀、pull-down、亚细胞共定位及生物信息学等方法,进行蛋白质间的相互作用及结构域分析;通过体外泛素化实验检测ARC1对筛选到的蛋白质泛素化的水平,免疫印迹的方法检测筛选到的蛋白质在授粉过程中的水平变化,从而阐释筛选到的蛋白质在SI上的功能。

项目摘要

ARC1作为S位点受体激酶的下游组分,在芸苔属自交不亲和信号通路中起正向调控因子的作用。在本项课题研究中,为了分离和鉴定ARC1的底物或调控因子,我们利用酵母双杂交系统来筛选ARC1相互作用的蛋白。以羽衣甘蓝S13bS13b自交不亲和系为材料,提取柱头的总RNA,利用CytoTrap XR 建库试剂盒构建羽衣甘蓝柱头cDNA文库。原始文库的库容量约为2.5×105,扩增后的文库库容量约为4×108。文库的重组率为96 %,插入片段大小在0.4-3.0 kb之间,平均长度约0.8 kb。将羽衣甘蓝ARC1全长克隆到酵母载体pSOS中,构建诱饵蛋白pSOS-BoARC1。将pSOS-BoARC1和pMYr-柱头cDNA文库共同转化酵母细胞,通过对1×106 个克隆的筛选,从中获得10个阳性克隆。序列分析表明,这10个阳性克隆编码JDP1部分氨基酸序列。JDP1全长cDNA序列为1326 bp,包含73 bp的5′非编码区、218 bp的3′非编码区和一个长度为1035 bp的开放读码框,对应编码一个含有344个氨基酸残基的蛋白质,相对分子质量约为38.4 kD,理论等电点为7.04。蛋白结构域分析显示,JDP1的N端JDP1(1-68)含有一个J结构域,而C端JDP1(69-344)未在数据库中找到相似的结构域。JDP1的mRNA在茎、叶、花瓣、花药、柱头、花柱和子房中均检测到表达;而且JDP1蛋白也在茎、叶、花瓣、花药、子房、花柱和柱头中表达。在酵母双杂交和体外结合实验中发现,JDP1(69-344)能够与ARC1相互作用。在拟南芥原生质体细胞内,JDP1(69-344)能够影响BoARC1的定位,并且共同定位细胞膜上,而JDP1全长和JDP1(1-68)的不能影响BoARC1的定位变化。这说明JDP1的C端介导了与ARC1的相互作用,而N端调控与ARC1的相互作用。此外,在授粉实验中,JDP1的蛋白质水平在亲和授粉后45 min内一直增加,而在自交不亲和授粉中JDP1在30 min后开始下降,说明JDP1可能在自交和异交授粉过程中起着不同的作用。从目前所获得的实验结果,我们认为JDP1可能通过调控ARC1的活性来参与自交不亲和信号通路。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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