巨魾鱼种质资源的分子遗传多样性分析

基本信息
批准号:31360638
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:50.00
负责人:杜民
学科分类:
依托单位:红河学院
批准年份:2013
结题年份:2017
起止时间:2014-01-01 - 2017-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:刘艳红,田树魁,李娜,杨会敏,牛宝珍,罗晶
关键词:
微卫星遗传多样性巨魾线粒体全序列
结项摘要

Genetic diversity is the basis of fish survival and evolution. It is one of the trends to study the biological diversity of fish through molecular techniques,especially which is on the more urgent to study the genetic diversity of the endangered fish. Bagarius yarrelli(Sykes),which is a specific rare econimical and endangered fish in Yunnan province,which reside in the Lancang River,Nujiang River and Yuanjiang River in China,is the research object in the project. We study their genetic diversity in these Rivers using two molecular techniques, microsatellite markers and mitochondrial DNA sequence methods, to explore their genetic variation in the genomic DNA and mitochondrial DNA level,in order to elaborate their genetic diversity among populations and within population, to analyze their evolutionary potential and to provide a reference for their future evolution. It has important theoretical significance and application values to lay the foundation of genetic differentiation between different geographical populations of the rare endanged fish,and to provide a scientific basis for conducting the genetic diversity monitoring,artificial propagation and species conservation work,also contribute to study the endangered causes and process of the rare species.

鱼类遗传多样性是鱼类生存与遗传进化的基础。利用分子技术手段对鱼类遗传多样性研究是生物多样性研究的发展趋势之一,而对濒危鱼类进行遗传多样性的研究就显得更加迫切。巨魾是云南省特有的珍稀名贵濒危鱼类,主要分布在澜沧江、怒江、元江等河流中。本项目以巨魾为研究对象,利用微卫星标记和线粒体全序列两种分子检测技术研究这一珍稀鱼类的遗传多样性,分别在核基因组DNA和线粒体DNA层次上探讨其遗传变异水平,阐明原产地不同巨魾种群间及种群内的遗传多样性水平,分析其进化潜力和为未来进化提供参考,既能为研究这一濒危鱼类不同地理群体之间的遗传分化奠定基础,还有助于对物种稀有或濒危原因及过程进行研究,又能为开展这一濒危鱼类的遗传多样性监测、人工繁殖及物种保护工作等提供科学依据,具有重要的理论意义和应用价值。

项目摘要

鱼类遗传多样性是鱼类生存与遗传进化的基础。利用分子技术手段对鱼类遗传多样性研究是生物多样性研究的发展趋势之一。巨魾是云南省特有的珍稀名贵濒危鱼类,主要分布在澜沧江、怒江、元江等河流中。本项目以巨魾为研究对象,从怒江的潞江坝和三江口镇江段、澜沧江的临沧和景洪市江段、元江的曼耗镇和河口县江段6个采样点,各采取40尾样本,共计240尾;利用转录组测序方法获得8568微卫星位点,经过聚丙烯酰胺凝胶电泳,获得多态性微卫星位点110对;利用多态性微卫星位点分别对这6个巨魾群体的遗传多样性进行研究,发现6个群体的遗传多样性分别均为中度多态;利用同源序列设计出20对巨魾鱼特有的线粒体引物,采用PCR克隆扩增出巨魾鱼的线粒体全长序列并递交到GenBank(登录号: KP342264);获得的72条线粒体全序列,利用其中ND4基因的全序列分析6个巨魾群体的遗传多样性表明澜沧江上游(L)、景洪(J)单倍型多样性和核苷酸多样性都高,遗传多样性丰富;而怒江坝(B)、红河河口(H)、红河曼耗(M)、怒江下游(N)出现单倍型多样性高,低核苷酸多样性的模式。本结果为研究这一濒危鱼类不同地理群体之间的遗传分化奠定基础,还有助于开展这一濒危鱼类的遗传多样性监测、人工繁殖及物种保护工作等提供科学依据,具有重要的理论意义和应用价值。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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