拟南芥中受十字花科黑腐病菌（Xcc）诱导(或抑制)的非编码RNA的鉴定

非编码RNA,也叫小RNA，是一类分子较小，通常不编码蛋白，但具有独立功能的RNA分子。非编码RNA广泛存在于各种物种中，并且在细胞的各种生理过程中发挥重要作用。最近的研究发现，一些拟南芥非编码RNA的表达受丁香假单胞菌侵染的特异诱导，并且在对抗丁香假单胞菌侵染的防卫反应中起重要作用。本申请课题的目的是，先利用Solexa测序技术,分别（平行）鉴定被十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc）侵染和没有Xcc侵染的拟南芥中表达的非编码RNA，然后通过统计和Northern杂交定量分析，比较在这两种条件下各非编码RNA的表达量，确定受Xcc诱导（或抑制）的非编码RNA，为研究非编码RNA在对抗Xcc侵染的防卫反应中的作用以及更全面地了解寄主植物与Xcc相互作用的分子机理奠定基础。

非编码RNA,也叫小RNA，是一类分子较小，通常不编码蛋白，但具有独立功能的RNA分子。非编码RNA广泛存在于各种物种中，并且在细胞的各种生理过程中发挥重要作用。最近的研究发现，一些拟南芥非编码RNA (miRNAs/siRNAs) 的表达受丁香假单胞菌（Pseudomonas syringae）侵染的特异诱导，并且在对抗丁香假单胞菌侵染的防卫反应中起重要作用。为了揭示拟南芥非编码RNA在对抗十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc）侵染的防卫反应中的作用，本研究利用Solexa RNA测序技术（RNA-Seq）,分别鉴定了被Xcc野生型菌株和III型分泌途径缺陷突变体ΔhrcV侵染以及没有被Xcc侵染的拟南芥叶片中表达的非编码RNA，通过比较在这三种情况下拟南芥miRNAs/siRNAs的表达差异，确定了受Xcc诱导（或抑制）的候选非编码RNA，进一步应用q-RT-PCR和定量Northern杂交方法对这些差异表达以及新发现的候选非编码RNA进行验证后，我们最终成功地鉴定了7个受Xcc诱导的拟南芥miRNA以及81个新的拟南芥miRNA。这些研究结果为深入研究拟南芥非编码RNA在对抗Xcc侵染的防卫反应中的作用奠定了基础。