印记snoRNA基因的起源与进化及其新功能研究

基本信息
批准号:30830066
项目类别:重点项目
资助金额:175.00
负责人:屈良鹄
学科分类:
依托单位:中山大学
批准年份:2008
结题年份:2012
起止时间:2009-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:余春红,邵鹏,杨建华,徐辉,官道刚,张意军,廖建友,陈一龄,陈晓红
关键词:
非编码RNA基因snoRNA哺乳动物分子进化基因组印记
结项摘要

高等哺乳动物基因组印记区包含大量的非编码RNA基因,这些非编码RNA基因如何在印记区中起源和进化及其与基因组印记发生的关系是表观遗传学中一个重要的问题。印记snoRNA属于box C/D snoRNA家族,是基因组印记区中一类重要的小分子非编码RNA,也是一个良好的研究模型。本项目以哺乳动物印记snoRNA为对象,采用先进的计算机分析与实验相结合的方法,在基因组水平系统地发掘和鉴定哺乳动物印记snoRNA,阐明印记snoRNA基因的起源时间和演化过程,研究印记snoRNA的新功能,揭示小分子非编码RNA在基因组印记中的调控作用及其进化的规律。

项目摘要

高等哺乳动物基因组印记区包含大量的非编码RNA 基因,这些非编码RNA基因如何在印记区中起源和进化及其与基因组印记发生的关系是现代表观遗传学中一个重要的问题。印记snoRNA 属于box C/D snoRNA 家族,是基因组印记区中一类重要的小分子非编码RNA,也是一个良好的研究模型。本项目以哺乳动物印记snoRNA 为对象,采用先进的计算机分析与实验相结合的方法,在基因组水平系统地发掘和鉴定哺乳动物印记snoRNA,完成了20多种动物snoRNA的基因组系统鉴定和进化分析,推测出印记snoRNA 基因的起源时间和在哺乳动物基因组的演化过程,并进一步揭示小分子非编码RNA 在基因组印记发生中的意义及其进化规律。构建了全面收入和系统发掘印记snoRNA及各种印记非编码RNA数据库ncRNAimprint以及基于新一代测序的小RNA发掘及功能分析平台DeepBase 和 starBase等。同时,在微RNA的结构、功能及在基因表达中的调控作用等方面也取得重要进展。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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