新疆维汉民族冠心病秽浊痰阻证基因组学分析及与地域因素交互作用研究

Many study confirmed that there are characteristic differences among different ethnic population in disease-related predisposing genes due to genetic heterogeneity and special regional factors. Early studies show that the incidence of coronary heart disease(CHD) is higher in Xinjiang than that in other province, and the pattern of TCM syndrome of CHD present a special regional feature,which the Huizhuotanzu type is the leading TCM syndrome type(46.7%),result from such special regional factors as cold and arid Climate, multiethnic aggregation, various folk custom and diet Habits Our study aim to explore the genetic differences of TCM Syndrome (Huizhuotanzu type and Non-Huizhuotanzu type) between Uygur and Han population,using genomewide expression profile microarray chip analyzed the differential expression of predisposing genes of CHD in Uygur and Han population with a TCM syndrome type of Huizhuoitanzu, Construction coexpression network by functional remark the differential expression gene channel, validated the screening genes by qRT-PCR in order to achieved the candidate genes,then construction TCM diagnostic model of CHD with Huizhuotanzu type in Xinjiang population,. Our study based on the special regional characteristc of TCM sydrome type of CHD in Uygur and Han population,genetical analyzed the differencies in TCM Zhenhou essence between two population by genomic and metabonomics methods, explore the internal mechanism,demonstrate the contribution of special regional characteristic of patterns of TCM syndrome to the pathogenesis of CHD with Huizhuotanzu type, established an evidence-based strategy of prevention and treatment on coronary heart disease correspond to the special regional environment in Xinjiang region.

大量研究证实，因特殊地域因素及遗传的异质性等导致不同民族存在着不同的易感基因与遗传特点。新疆冠心病因其特殊的地域性因素（气候寒冷干燥、多民族聚集、不同的民俗及饮食习惯等）及不同民族的遗传特征，冠心病发病率高于全国且中医证型具地域特点。前期研究显示，秽浊痰阻证占新疆冠心病患者的46.7%。本项目以维、汉民族秽浊痰阻证与非秽浊痰阻证冠心病患者为研究对象，采用全基因组表达谱芯片，研究秽浊痰阻证的基因表达谱；基于基因数据库对差异基因进行功能和通路注释，构建共表达网络图。运用qRT-PCR对筛选出的差异基因进行芯片结果验证，并筛选出显著性差异基因，构建新疆冠心病秽浊痰阻证的的诊断模型。本研究以维、汉民族冠心病中医证型特征为基础，通过证候要素与基因组学及代谢组学的研究，寻找维、汉民族冠心病秽浊痰阻证生物学基础，揭示发病机制，为本地区冠心病的防治提供新的思路和方法。

大量研究证实，因特殊地域因素及遗传的异质性等导致不同民族存在着不同的易感基因与遗传特点。由于特殊的区域性因素（气候寒冷干燥、多民族聚集、不同的民俗及饮食习惯等）及不同民族的遗传背景，新疆地区冠心病发病率高于全国，且该地区冠心病的特征满足中医证型的地域特点。(1)本研究以维、汉民族冠心病所具备的生理生化特征为基础，寻找维、汉民族冠心病发病的生物学基础差异。结果表明，维吾尔族冠心病患者与汉族冠心病患者的部分生化指标存在显著差异。（2）本研究以维族及汉族冠心病患者中秽浊痰阻证型与非秽浊痰阻证为研究对象，使用转录组芯片，研究秽浊痰阻证冠心病患者的表达谱特点，同时进一步使用基因注释数据库对差异表达基因进行功能和通路注释。结果表明，在疾病组和正常组之间存在大量差异基因，这些差异表达基因显著富集在与冠心病相关的多条功能通路中。（3）本项目同时对维、汉民族不同中医证型的患者进行研究，不同民族同一证型间的差异表达基因具有相似的表达特性。研究发现ERK/MAPK信号转导通路与秽浊痰阻证的发生具有较高的相关性，共有42个基因发生共性显著变化，其中34个表达上调，8个表达显著下调，秽浊痰阻证与非秽浊痰阻证冠心病患者的表型差异可能与其共性差异表达基因有关。（4）使用荧光定量多聚酶链式反应技术对转录组芯片筛选获得的差异表达基因进行验证，筛选获得的差异表达的5个基因,并对参与其调控的ncRNA进行预测，发现miR-15，miR-16，miR-10可能通过对ERK/MAPK通路相关基因的表达调控参与秽浊痰阻证冠心病的发生。（5）本项目还采用SNaPshot检测技术检测出所有样本TGF-β1基因的rs1800469、rs2241715、rs480345、rs8110090、rs8105161、rs2241716、rs1800470、rs1800471八个位点的基因型，分析各基因多态性与维、汉民族冠心病及其中医证型的相关性，发现TGF-β1基因rs8105161、rs2241716两个位点的基因多态性可能与冠心病发病有关联，rs8110090、rs8105161、rs1800471的基因多态性在维、汉两个民族间有差异，但TGF-β1基因在秽浊痰阻证、非秽浊痰阻证型组间未见明显差异。本研究结果为揭示新疆地区冠心病的发病机制提供了基因学基础，同时，也为本地区冠心病的防治提供了新的思路和方法。