水稻芽期耐冷性主效QTL精细定位与克隆研究

以含有水稻芽期耐冷性主效QTL qSCT-11的染色体片段代换单株SL-D5-26为起始材料，利用SSR、SCAR和CAPS等DNA标记构建目标区段的高密遗传图谱；从来源于SL-D5-26的F2大群体（2000~3000个单株）中筛选目标区段的染色体片段重叠代换系，通过代换作图对QTL qSCT-11进行精细定位；构建供体亲本Lemont的BIBAC基因组文库；经文库筛选后，利用阳性克隆构建包含目标QTL区段的物理图谱；对克隆片段测序后进行候选基因分析。此外，还将分析QTL qSCT-11的遗传方式，进行加性和显性效应的再估计；分析QTL qSCT-11对水稻苗期、孕穗开花期耐冷性及产量相关性状的多效性。上述QTL qSCT-11的精细定位和克隆研究，是通过图位克隆法克隆分离该QTL基因的关键步骤；也将为水稻水稻耐冷性的分子标记辅助育种提供与耐冷性基因紧密连锁的分子标记。