植物病毒编码的RNA沉默抑制子预测及作用机理的生物信息学研究

鉴定出更多的植物病毒编码RNA沉默抑制子是深入研究RNA沉默机理，发展新的植物抗病毒策略的必然要求。RNA沉默抑制子序列、结构、本身功能及作用机理都具有多样性，且已知抑制子数量有限,这使得单纯应用基于序列相似性或结构功能相似性的传统生物信息学方法寻找新的抑制子效率很低。在本项目中，我们将以植物病毒编码RNA沉默抑制子为研究对象，为已知植物病毒编码RNA沉默抑制子和相关植物病毒基因建立一种新的数学形式描述方法，从原理上突破传统的基于序列相似性的分析方法，将基因核酸序列从一维映射到高维，将一维序列问题转化为高维数学空间结构问题；进而在低样本量需求的前提下，不通过序列同源性和保守性比对，而根据高维空间几何分析理论分析基因在高维空间中的分布形态，构造多权值人工神经网络模型，预测新植物病毒编码RNA沉默抑制子，并对其进行作用机理的分型分析。