水稻编码区插入/缺失与抗逆机制的进化基因组研究

人工选择下家养动植物表型多样化的遗传基础是进化生物学研究的难点之一。从全基因组水平，利用水稻编码区插入/缺失（indel）研究籼、粳亚种间抗性分化为探讨这一问题提供了极好切入点。本研究将通过籼粳稻比较基因组分析构建水稻编码区indel基因数据库，实现资源共享；据此联系已有水稻数量性状位点（QTL），筛选与籼、粳稻抗性表型多样化相关的候选基因；利用新一代高通量测序技术（Solexa）对候选基因进行群体基因组学研究，首次获得水稻编码区indel在野生稻和栽培稻基因组中的频率分布式样和进化特点，评估人工选择在水稻基因组进化中的作用模式，揭示籼粳稻亚种间抗性分化的遗传基础，为理解水稻起源、驯化的适应性进化历程提供新证据，为提高水稻抗性的分子育种提供新基因资源。