候选基因甲基化状态与胶质母细胞瘤及其它类别胶质瘤预后关系的研究

Glioblastoma (Glioblastoma Multiforme, GBM) is the most common and malignant brain tumor. Histology-based classifications can not accurately predict the patients' prognosis or clinical behavior. It is necessary to define the subtypes at epigenetic levels to complement the traditional morphological classification. In our previous study，we builded the whole genomic methylation profiling of GBM by methylation chip technology.Then, we picked out 10 genes which had the most significant differences of methylation levels according to patients' survival time. In this project，we intend to, firstly verify the relationship between methylation status of specific candidate gene and prognosis of GBM; secondly, further determine the power of specific methylation profiles of the 10 genes for GBM subtype classification by comparing with the well-recognized molecular markers such as MGMT, IDH1 and KI-67; lastly, test the role of this specific methylation profiles in the other types of gliomas.

胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme, GBM）是最为常见且恶性度最高的脑肿瘤。以组织学为基础的分类方法不能准确判定患者的预后等临床行为，发现并利用肿瘤细胞的分子改变对肿瘤进一步亚分类，是对传统形态学分型方法的必要补充。我们在前期研究中：通过甲基化芯片技术构建了胶质母细胞瘤的全基因组甲基化图谱，初步筛选出与患者长生存时间密切相关的10个甲基化差异表达基因。本课题拟对一批新发的胶质母细胞瘤患者标本行DNA甲基化芯片检测，以患者的无进展生存时间和生存时间为参考，进一步判定这10个基因的甲基化情况与患者预后的关系，并与已明确的分子标记物（MGMT、IDH1、Ki-67）进行比较，判定其效能；同时初步判定它们在其它类型胶质瘤预后评估、分子分型中的作用。

背景：启动子区域的甲基化是影响肿瘤基因表达的重要机制。最新脑肿瘤的甲基化研究发现一些新的后天修饰基因。我们的目的是研究启动子甲基化抑制基因的表达与胶质母细胞瘤患者的生存时间的关系。.方法及结果：.1.通过对65名胶质瘤患者的组织进行焦磷酸测序，独立验证PDE4C启动子甲基化水平，发现在低级别患者中，66.67%有PDE4C低甲基化；高级别患者中，78.38%有PDE4C高甲基化。卡方检验显示有统计学意义。.2.我们通过对甲基化芯片包含的56个高级别胶质瘤患者的临床资料进行分析，发现单一因素的条件下，KPS，切除范围和PDE4C的甲基化水平都有统计学意义；但多因素综合分析，发现只有KPS和PDE4C的甲基化水平具有统计学意义。.3.通过甲基化芯片数据和CGGA资料库数据进行分析，在高低级别胶质瘤中，PDE4C的甲基化差异有统计学意义，低级别病人PDE4C甲基化水平低于高级别病人；.4.为了排除肿瘤级别对生存率的影响，我们只采用高级别胶质瘤病人进行PDE4C甲基化的生存分析，PDE4C低甲基化的病人生存率高于PDE4C高甲基化的病人。