橡胶树响应低温胁迫microRNAs的克隆、鉴定及调控机制研究

基本信息
批准号:30960319
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:25.00
负责人:安泽伟
学科分类:
依托单位:中国热带农业科学院
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:程汉,韦家少,吴春太,祝建顺,谢黎黎,张燕燕
关键词:
橡胶树低温小RNAmicroRNA胁迫
结项摘要

microRNAs(miRNAs)是一类内源非编码RNA,具有调控植物生长发育及抗逆反应的生物小分子。橡胶树是天然橡胶的主要来源,是我国热区的重要经济作物,对其应答低温的miRNAs进行系统鉴定和功能分析将有助于深入理解橡胶树抗寒的分子本质。本研究采用比较miRNAs组学的研究方法,分别构建橡胶树抗寒和不抗寒品种受低温胁迫的miRNAs文库,对文库进行大规模序列测定;进而通过同源比对和二级结构分析,结合Northern杂交,系统鉴定出橡胶树应答低温胁迫的miRNAs;预测这些miRNAs的靶基因,并用5'-RACE方法检测它们切割靶基因的生化功能,对靶基因进行鉴定;用miRNAs芯片技术分析miRNAs及其靶基因在橡胶树组织中特异分布及诱导表达特征,并分析、比较抗寒与不抗寒两组材料中特异表达与共同表达的miRNAs特性,为研究miRNAs参与橡胶树抗寒调控网络的分子机制奠定基础。

项目摘要

橡胶树是天然橡胶的主要来源,是我国热区的重要经济作物,对其应答低温的miRNAs 进行系统鉴定和功能分析将有助于深入理解橡胶树抗寒的分子本质。本研究采用比较miRNAs 组学的研究方法,分别构建了橡胶树抗寒和不抗寒品种受低温胁迫的miRNAs 文库,通过对文库进行序列测定和同源比对与二级结构分析,获得了115个候选miRNAs;结合Northern 杂交,鉴定出33个橡胶树应答低温胁迫的miRNAs;利用生物信息学方法对miRNAs 的靶基因进行预测,并用5'-RACE 方法对靶基因进行鉴定,共获得42个靶基因,靶基因以MYB和NAC类转录因子为主,部分miRNAs调控多个靶基因;通过反向Northern 技术分析了miRNAs 的表达谱,33个miRNAs的表达具有组织特异性,其中有10个miRNAs在胁迫前后表达差异为极显著,15个为表达差异显著,miRNA774和miRNA1037为在抗寒品种93-114中特异表达的基因;25个差异表达基因中,17个呈上调表达,8个呈下调表达,靶基因的表达趋势与miRNAs的相反。项目的实施为研究miRNAs 参与橡胶树抗寒调控网络的分子机制奠定了基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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