hES及hiPS X染色体倾斜性失活与基因组失衡关联研究

基本信息
批准号:31171229
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:孙筱放
学科分类:
依托单位:广州医科大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:沈亦平,何文智,黄盛昌,凌家炜,余波澜,郑育红,潘倩莹,欧展辉,郭小桥
关键词:
干细胞X染色体失活倾斜性基因组失衡
结项摘要

X染色体失活(XCI)是人类表观遗传研究的重要内容,其倾斜性失活机制仍不明确。研究证实,人胚胎干细胞(hESC)与某些基因组失衡且表观异常疾病(如X染色体连锁智力发育迟缓类疾病)具有相似的极度倾斜性XCI现象,我们前期课题(NSFC:30871378)发现,倾斜性XCI的hESC存在DNMT、Nanog等基因区域微小基因组失衡。我们推断,除了DNA甲基化及组蛋白修饰外,基因组水平的微小失衡与hESC倾斜性XCI也高度相关。.本课题拟以hESC和先天表观异常的hiPS为对象,结合基因组和表达谱芯片等方法,在全基因组内寻找与倾斜性XCI高度关联的拷贝数变异(CNV)、杂合性丢失(LOH)等区域并明确其基因调控网络和信号通路,筛选出候选基因并在随机失活干细胞中进行转染高表达或RNA干扰验证,明确基因组失衡影响X染色体倾斜性失活机制,阐明异常失活调控通路,丰富干细胞表观遗传调控理论

项目摘要

X 染色体失活(XCI) 是人类表观遗传研究的重要内容,其倾斜性失活机制仍不明确。我们前期课题( NSFC:30871378)发现,倾斜性 XCI 的 hESC 存在 DNMT、 Nanog 等基因区域微小基因组失衡。我们推断,除了DNA 甲基化及组蛋白修饰外,基因组水平的微小失衡与 hESC 倾斜性 XCI 也高度相关。.本课题以 hESC 和先天表观异常的 hiPS 为对象,结合基因组和表达谱芯片等方法,证明基因组的拷贝数变异( CNV)、杂合性丢失( LOH)与倾斜性 XCI 高度关联,并明确其基因调控网络和信号通路,筛选出候选基因并在随机失活干细胞中进行转染高表达证明该基因与XCI的相关性。从而明确基因组失衡影响 X 染色体倾斜性失活机制,阐明异常失活调控通路,丰富干细胞表观遗传调控理论。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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