蛋白质与抑制剂的结合动力学及其在药物设计中的应用

以全局极小化方法为核心，研究的蛋白质与抑剂的相互作用问题，主要涉及以下两个方面：（1）平滑积分变换方法在分子快速自动以接中的应用，采用特殊函数拟合方法，解决了非Gaussian型权重函数情况下平滑积分变换的解析计算问题，并组出相应简便算法；（2）Monte Carlo方法模拟蛋白质与抑制剂系统在复杂能量地形上的演化过程，由此对抑制剂与蛋白质的结合能力作出估计。以上算法对分子对接模型和HIV蛋白酶抑制剂系统的计算得到比较满意的结果，达到了预定目标。在固定靶蛋白的情况下，可以实现对10（5）规模小分子库的快速筛选。全局算法实现为以三个全局极小搜索引擎为主以及若干辅助程序包，可以用于大分子相互作用理论研究和药物分子筛选及计算机辅助设计。