用复杂网络方法研究蛋白质折叠

运用复杂网络的思想方法，依据氨基酸残基的几何和相互作用性质，构建以氨基酸残基为节点的蛋白质氨基酸网络，分析网络特性，研究蛋白质折叠过程的关键残基与活性位点。构建以蛋白质不同构象为节点的蛋白质折叠网络，通过对网络特征量的分析，研究蛋白质折叠路径，探索网络拓扑结构与蛋白质功能的关系。通过分析蛋白质分子定点突变体网络特征量的变化，研究定位点突变对蛋白质结构及稳定性的影响。把时间序列分析方法引入到蛋白质折叠网络的研究，分析复杂网络结构中的长程关联性质,进一步发展新的复杂网络分析方法。总结建立与网络构建、网络分析、网络特征量提取等有关的计算机模拟程序。本研究属于物理学与生物学的交叉领域，重点从蛋白质折叠网络的研究为切入点，为蛋白质折叠机理和结构-功能关系的研究提供理论基础。