基于近似重复矢量的DNA序列数据压缩算法研究
基本信息
批准号：60872125
项目类别：面上项目
资助金额：32.00
负责人：纪震
学科分类：
依托单位：深圳大学
批准年份：2008
结题年份：2011
起止时间：2009-01-01 - 2011-12-31
项目状态： 已结题
项目参与者：杜智华,薛丽萍,储颖,廖惠连,周家锐,杨太康
关键词：
DNA序列数据压缩近似重复矢量码书设计生物启发式优化算法仿生聚类
结项摘要
针对DNA序列数据每天以海量速度增长和占用存储空间日益增加的问题,本项目研究基于矢量的DNA序列数据压缩算法。.在DNA序列数据压缩过程中发掘序列的生物学解释,采用生物启发式优化算法实现高效的DNA序列仿生聚类，生成编码性能更高的近似重复矢量，替代传统的重复子串匹配方法是本项目追求的目标。.本项目将利用近似重复矢量编码技术寻求DNA序列数据无损压缩中的最佳码书设计。运用生物学知识构建具有生物信息学知识的DNA序列仿生聚类, 寻找序列的生物特性,提取近似重复矢量,构造DNA序列数据的近似重复矢量的数学模型，认识和掌握其内在机理和本质特性。.` 本项目将DNA序列数据压缩研究从"精确重复子串匹配"、"最长精确重复子串匹配"、"近似重复子串匹配"拓展到"近似重复矢量"阶段，在国际上属于源头创新，对于提高DNA序列数据编码效率有着重要的理论价值。
项目摘要
项目成果
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数据更新时间：2023-05-31
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